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很多植物病原菌严重地损害植物的生长和繁殖。植物与病原体协同进化过程中，也逐渐形成了一系列复杂高效的保护机制来抵御病原物的侵染。植物中抵抗外界微生物刺激所形成的系统被称为植物天然免疫系统，可分为两个层次。第1个层次是植物模式识别受体（PRRs）识别病原相关分子模式（PAMPs），触发病原相关分子模式触发的免疫反应（PTI），激活植物体中促丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号通路使植物产生早期应答反应。PTI适应性较广，可识别和响应包括非致病菌的许多类微生物。第2个层次是病原菌产生效应因子抑制基础免疫响应PTI