位置权重矩阵相关论文
基因表达调控是理解生物体遗传机制,破解生物体奥秘的关键所在。转录是基因表达至关重要的一步,对转录因子结合位点进行识别与注释......
由于基因序列中的功能位点与基因的调控、转录紧密相关,人们对这些位点进行了广泛的分析。如何从DNA序列中准确地检测出这些功能位......
随着人类基因组计划的开展与现代生物技术的迅猛发展,生物信息数据的增长呈现爆炸之势,这为揭开生命奥秘提供了数据基础；计算机运算......
揭示基因组水平上的基因表达调控规律是生物信息学和分子生物学所面临的挑战性问题之一。转录调控是基因表达调控的关键步骤,转录......
TAL效应物(Transcription activator-like effectors)是黄单胞菌属植物病原菌分泌的一种特殊的三型效应物,在病原菌与寄主相互作用......
人类基因组测序计划的研究表明,在人类基因组中,仅有不到全部基因组序列2%的基因具有编码蛋白质的功能,其余是缺乏蛋白质编码能力......
生物信息学起步于20世纪90年代，是一门新兴的交叉学科.先进的测序技术使得各种生物的基因以及蛋白质序列被大量测出，为生物信息学的......
在人类cDNA序列确定全长基因的过程中,必须判断第一个ATG密码子是真正的起始密码子还是框内的非起始作用的甲硫氨酸密码子.在总结......
基于在转录因子结合位点各碱基出现的概率不相同，以转录因子结合位点每一位置的碱基保守程度为参量，分别计算每种转录因子结合位点在......
蛋白质二级结构预测是三级结构预测的一个非常重要的中间步骤，而折叠子识别和结构类型的准确预测则可以提高二级结构和三级结构预测......
依据β-发夹氨基酸序列中的保守性特征，分别以氨基酸（20种氨基酸和一个空位）和氨基酸紧邻关联为参数，通过构建位置权重矩阵和选取氨基......
核小体定位对真核生物基因表达调控发挥着重要作用。前期基于核小体核心及连接区域的k-mer频次分布偏好性，构建了位置权重矩阵算法，......
在人类cDNA序列确定全长基因的过程中，必须判断第一个ATG密码子是真正的起始密码子还是框内的非起始作用的甲硫氨酸密码子，在总结了......
对实验确定的168条σ54启动子序列进行保守性分析，获得两个保守的区域-24区域和-12区域，均为最保守的功能元件。选取保守性最大的17......
在人类基因组上正确识别转录调控信号仍然是分子生物学界面临的重要挑战，目前计算的手段仍然是寻找转录调控元件的主要方法。然而这......
真核生物基因序列包括编码的外显子序列和不编码的内含子序列,在转录过程中内含子被切除,外显子将有序的拼接在一起形成mRNA。而选......
为研究高通量的人类CD4＋T细胞的核小体定位模式,使用迭代算法对核小体定位模式进行分类,并利用位置权重矩阵方法分别构建稳定核小体......
转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)是与转录因子结合的DNA序列,它们与转录因子相互作用调控基因的转录过......
真核生物翻译起始位点(TIS,translation initiation site)的正确预测对于基因的正确注释有着重大的意义.在真核生物中,翻译并不都......
当前有许多用于预测模体的算法，但没有一种算法能有效地应用在所有场合。依据位置权重矩阵的模体模型，提出一种改进的吉布斯采样算法......
多聚腺苷酸化是真核细胞内形成成熟mRNA的一个重要步骤,其位点的预测对基因组序列中编码基因的发掘具有重要的参考价值.本研究以缺......
