【摘 要】
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[目的]本课题组前期从发酵鱼露中筛得一株高效生物胺降解菌Halomonas shantousis SWA25.为明确该菌中与生物胺降解相关的关键基因的生物学信息并验证其功能,本文在全基因组测序基础上对关键基因进行了筛选和表达验证.[方法]通过全基因组测序获得SWA25所有编码基因信息,利用6个数据库(GO、KEGG、COG、NR、Swiss-Prot、TrEMBL)注释结果筛选关键酶基因,采用SY
【机 构】
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中国海洋大学食品科学与工程学院,山东青岛266003
【出 处】
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2016年中国水产学会水产品加工与综合利用分会学术年会
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[目的]本课题组前期从发酵鱼露中筛得一株高效生物胺降解菌Halomonas shantousis SWA25.为明确该菌中与生物胺降解相关的关键基因的生物学信息并验证其功能,本文在全基因组测序基础上对关键基因进行了筛选和表达验证.[方法]通过全基因组测序获得SWA25所有编码基因信息,利用6个数据库(GO、KEGG、COG、NR、Swiss-Prot、TrEMBL)注释结果筛选关键酶基因,采用SYBR Green qRT-PCR技术对SWA25生物胺降解关键基因进行表达验证.[结果]测序结果显示： SWA25基因组大小为4.13Mb,编码基因3719个.共筛选到4个生物胺降解酶基因和6个可能与生物胺降解途径相关的基因.qRT-PCR结果显示,与对照组相比,八种生物胺各100 mg/L混合液胁迫可显著提高SWA25中生物胺降解酶基因mauA、mauB、vanA、vanB的mRNA表达水平.生物胺降解酶基因表达量的提高可降低生物胺对细胞的毒性,维持细胞正常生理功能.生物胺胁迫可显著提高SWA25中基因afuC、aguB、OTC1、OTC2、puuB1、puuB2的表达,由此推测这些基因的表达产物可能参与生物胺的降解途径,促进生物胺的快速降解.此外,当生物胺混合液浓度提高到150 mg/L时,除OTC1和puuB1,其余8个基因的表达量提高程度均低于100 mg/L混合液胁迫组,推测150 mg/L的生物胺胁迫使得SWA25的生长、细胞过程和代谢通路受到抑制.[结论]筛选得到的10个关键基因均直接或间接参与生物胺降解,以期为生物胺降解通路研究、高效生物胺降解工程菌的构建和生物胺降解酶的大量表达应用提供理论参考.
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