论文部分内容阅读
目的:验证DNMT1在胃癌细胞中的异常表达,观察DNMT1对胃癌细胞迁移、增殖、凋亡的作用,并通过生信技术筛选DNMT1的上游分子机制。方法:1.通过实时荧光定量PCR(RT-q PCR)和蛋白印迹(western blot)检测DNMT1在正常胃上皮细胞(GES-1)和胃癌细胞(MGC-803、SGC-7901、MKN-28)中m RNA水平和蛋白水平的相对表达量。2.使用小干扰RNA(si RNA)技术抑制胃癌细胞(MGC-803、SGC-7901)中DNMT1的表达,并通过RT-q PCR和WB检测si RNA的干扰效果。运用细胞划痕法、CCK-8法和流式细胞技术观察DNMT1对胃癌细胞迁移、增殖、凋亡的影响。3.在Target Scan数据库、miRDB数据库、ENCORI数据库中预测DNMT1的上游miRNA,使用韦恩图软件将结果进行交集。使用miRanda软件分析交集中miRNA与DNMT1的结合程度以及热力学稳定性,根据分析结果,通过RTq PCR在正常胃上皮细胞(GES-1)和胃癌细胞(MGC-803、SGC-7901、MKN-28)中进行验证。4.设计miR-4644 mimics转染胃癌细胞(MGC-803、SGC-7901),使用RT-q PCR和WB检测过表达miR-4644后DNMT1 RNA和蛋白的表达量变化,进一步探讨miR-4644对DNMT1的影响。5.在DIANA数据库、ENCORI数据库、star Base数据库中预测miR-4644的上游lnc RNA,使用韦恩图软件将结果进行交集。通过RT-q PCR检测三个数据库中共有的lnc RNA在正常胃上皮细胞(GES-1)和胃癌细胞(MGC-803、SGC-7901)中的相对表达量,确定与miR-4644—DNMT1相互影响的lnc RNA。结果:1.与正常胃上皮细胞GES-1相比,DNMT1 RNA在胃癌细胞MGC-803、SGC-7901、MKN-28中分别高表达了6.9倍、9.1倍、3.1倍(P均<0.01);DNMT1蛋白在胃癌细胞MGC-803中高表达了3.1倍(P<0.01),在SGC-7901和MKN-28中分别高表达了2倍和2.4倍(P均<0.05)。2.使用si RNA抑制DNMT1后,MGC-803和SGC-7901细胞的迁移率分别降低了45%和54%(P均<0.01);24小时细胞活力分别降低了28.8%(P<0.01)和6.1%(P<0.05);48小时细胞活力分别降低了36.5%(P<0.01)和31.1%(P<0.05)。此外,抑制DNMT1能够使SGC-7901细胞的凋亡率提高60%(P<0.05),但对MGC-803的凋亡水平没有显著影响(P>0.05)。3.三个数据库交集出8个DNMT1可能的上游miRNA,即:hsa-miR-148a-3p、hsa-miR-148b-3p、hsa-miR-152-3p、hsa-miR-185-5p、hsa-miR-3163、hsa-miR-4306、hsa-miR-4644、hsa-miR-5094。其中hsa-miR-4644在结合程度排名中位居第四。经细胞株验证,miR-4644在胃癌细胞MGC-803、SGC-7901、MKN-28中异常低表达(P均<0.05);在MGC-803、SGC-7901中敲低DNMT1后,miR-4644的表达量分别增高了79%(P<0.01)和38%(P<0.05)。4.设计miR-4644 mimics转染胃癌细胞MGC-803、SGC-7901,转染后miR-4644的表达量显著提高(P均<0.01);DNMT1的RNA表达量分别降低了32%和39%(P均<0.01);DNMT1的蛋白表达量分别降低了17%(P<0.05)和29%(P<0.01)。5.三个数据库交集出3个miR-4644可能的上游lnc RNA:XIST、MALAT1、ZNF674-AS1。在胃癌细胞MGC-803、SGC-7901过表达miR-4644后,ZNF674-AS1的表达量分别下降了41%和82%(P均<0.05);在MGC-803、SGC-7901细胞敲低DNMT1后,ZNF674-AS1的表达量分别下降了42%(P<0.05)和48%(P<0.01)。结论:1.DNMT1在胃癌细胞MGC-803、SGC-7901、MKN-28中高表达。抑制DNMT1的表达能够抑制胃癌细胞MGC-803、SGC-7901的迁移和增殖,促进胃癌细胞SGC-7901的凋亡,但对MGC-803的凋亡水平没有影响。2.miR-4644在胃癌细胞MGC-803及SGC-7901中抑制DNMT1的表达。在胃癌细胞MGC-803及SGC-7901中,lnc RNA ZNF674-AS1、miR-4644、DNMT1之间存在相互影响。