【摘 要】
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目的:研究难治性根尖周炎患牙根尖1/3根管内外微生物的多样性,探索导致根尖周病变不愈合的可能相关细菌,为后续研究及根管治疗过程中的感染控制提供实验基础。方法:1、收集临床诊断为难治性根尖周炎患牙的根尖1/3样本11例,通过处理获得根管内样本11个,根外样本11个,提取样本DNA（Deoxyribonucleic acid,脱氧核糖核酸）后采用Illumina Misqe测序平台对其16S r RN
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目的:研究难治性根尖周炎患牙根尖1/3根管内外微生物的多样性,探索导致根尖周病变不愈合的可能相关细菌,为后续研究及根管治疗过程中的感染控制提供实验基础。方法:1、收集临床诊断为难治性根尖周炎患牙的根尖1/3样本11例,通过处理获得根管内样本11个,根外样本11个,提取样本DNA（Deoxyribonucleic acid,脱氧核糖核酸）后采用Illumina Misqe测序平台对其16S r RNA（16S Rribosomal aibonucleic acid,16S核糖体核糖核酸）进行测序,再对测序所得的数据进行分析。2、对测序所得的数据进行处理得到OTU（Operational taxonomic unit,操作分类单元）代表序列,与RDP数据库进行比对,找出其最相近且可信度达80%以上的种属信息,得到样本中门、纲、目、科、属5个水平的分类单元。3、对所得的OTU及微生物种类进行Alpha多样性分析、物种组成分析、Beta多样性分析、样本微生物相关性及多样性分析,并进行群落多样性与临床症状的关系分析。结果:1、对22个样本进行高通量测序分析,所有样本的细菌DNA都为阳性,测序结果与RDP数据库进行比对,在97%的相似水平下,共获得2230种OTU,1520452个OTU,归属于25个门,57个纲,96个目,180个科,397个属。其中根内组样本共获得1693种OTU,共639110个OTU,归属于24个门,55个纲,88个目,155个科,256个属。根外组样本共获得1247种OTU,465973个OTU,归属于23个门,51个纲,82个目,162个科,298个属。2、各样本Coverage均为1.00,表明本次测序的结果代表了样本的真实情况。稀释性曲线显示各样本的测序数据量合理。Pan/Core曲线显示本实验样本量充足,可以进行数据分析。3、2组有10个菌门是共有的,其中变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门在门水平丰度较高,占80%以上,仅变形菌门在根内根外组所有样本中均有分布且在90.9%的样本中含量最丰富。2组中共有的且含量较丰富的属有26种,其中伯克霍尔德菌属和苯基杆菌属最丰富,苯基杆菌属、慢生型大豆根瘤菌、Bosea菌、鞘氨醇单胞菌在两组样本中检出率为100%,有症状的难治性根尖周炎根尖1/3微生物群落多样性较有症状组高。两组样本的微生物组成在门水平上的差异均无统计学意义（P＞0.05）,在属水平有2个属的差异具有统计学意义（P＜0.05）,为粪杆菌属、罗斯氏菌属,其在根内组的含量较高。结论:1、变形菌门在难治性根尖周炎患牙根尖1/3根管内外微生物群落中占主要地位,以伯克霍尔德菌属和苯基杆菌属为主。2、无症状的难治性根尖周炎根尖1/3微生物群落多样性较有症状组高。3、难治性根尖周炎根尖1/3根管内外均有丰富且多样的微生物,其组成较为相似。
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