结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis,Mtb）因呈现“休眠”状态而在宿主体内长期滞留感染,表明Mtb利用转录调控蛋白调控目的基因的表达以快速适应环境的变化,使其能够在宿主体内存活多年甚至更久。因此,阐明结核分枝杆菌转录调控蛋白的调控机制,从而为研发治疗持留感染的新型药物奠定基础。Rv3557c（KstR2）隶属于TetR家族转录调控蛋白,目前对其研究的报道较少,其直接作用的靶点及小分子对调控的影响机制尚不清楚。因此,研究Rv3557c（KstR2）转录调控蛋白的调控机制具有重要意义。本研究以Mtb H37Rv基因组DNA为模板,应用PCR方法扩增KstR2基因后构建了重组表达载体pET-22b-KstR2,经转化、诱导后得到重组蛋白KstR2,以此纯化蛋白开展下列研究工作:通过凝胶迁移试验（EMSA）和染色质免疫沉淀（ChIP）试验测定KstR2与靶基因的结合情况,结果显示KstR2与rv2549c启动子在体外与体内均结合,表明rv2549c基因的转录受KstR2的调控,且该蛋白与位于rv2549c转录起始位点上游155bp处的12个碱基序列结合,而KstR2与rv2549c启动子区域的体外结合则被氨基酸类（异亮氨酸、谷氨酰胺、组氨酸、酪氨酸）、维生素类(V_B6、V_C)、金属离子类(Pb²⁺、Mn²⁺、Cu²⁺)和其他小分子类（c-di-GMP、四环素、胆固醇、dATP、dTTP、dCTP、dGTP）所抑制。进一步的DNA大沟小沟结合试验表明,KstR2可与DNA的大沟结合。通过分子对接试验表明,KstR2的Tyr108、Gln109氨基酸残基在蛋白质与小分子的相互作用中起重要作用。通过过表达含有pMV262-KstR2重组质粒的BCG并进行转录组学分析,结果发现有117个基因差异表达,其中上调基因有105个、下调基因有12个,EMSA试验验证KstR2与选择的47个基因均结合,表明KstR2具有广谱的调控基因转录的功能。综上所述,除了rv2549c为TetR家族蛋白KstR2新的调控靶点之外,KstR2还可以调控其他多个基因表达,该研究进一步完善了KstR2的转录调控网络,为研发新型抗Mtb制剂奠定基础。