【摘 要】
:
Argonaute(Ago)蛋白质是一种可编程核酸酶,广泛分布于真核生物和原核生物。真核生物Ago蛋白质在RNA干扰途径中起关键作用,能够在小RNA或者小DNA的引导下识别甚至切割与之互补的RNA。原核生物Ago蛋白质可能参与宿主防御和DNA复制,偏爱在小DNA的引导下切割与之互补的DNA。Ago蛋白质已经在核酸检测和遗传操作等方面得以应用,为了进一步拓展基于Ago蛋白质的核酸操作工具,我们通过生
论文部分内容阅读
Argonaute(Ago)蛋白质是一种可编程核酸酶,广泛分布于真核生物和原核生物。真核生物Ago蛋白质在RNA干扰途径中起关键作用,能够在小RNA或者小DNA的引导下识别甚至切割与之互补的RNA。原核生物Ago蛋白质可能参与宿主防御和DNA复制,偏爱在小DNA的引导下切割与之互补的DNA。Ago蛋白质已经在核酸检测和遗传操作等方面得以应用,为了进一步拓展基于Ago蛋白质的核酸操作工具,我们通过生物信息学手段检索到一种来源于甜瓜黑点根腐病菌又称坎诺单孢菌(Monosporascus cannonballus)的Ago蛋白质(McAgo)。McAgo的氨基酸序列与已报道的Ago蛋白质的序列一致性不超过25%,但具有保守的催化四联体氨基酸DEDD,推测McAgo可能是一个新的有活性的Ago蛋白质。将McAgo基因经大肠杆菌密码子优化后克隆到p ET28a载体上,后续为了更好的纯化在McAgo基因的N端融合CL7标签并通过IM7-CL7纯化方法得到了高纯度的McAgo蛋白质。核酸提取实验表明McAgo与大多数Ago蛋白质一样结合有20-33 nt的小RNA。活性测定实验表明,McAgo能以5′端磷酸化或羟基化的RNA为引导来切割与之互补的RNA,并且切割位点位于引导链5′到3′的10到11个碱基之间。McAgo需要二价金属离子来激活切割,且在Mg2+条件下效果最好。此外,McAgo在氯化钠浓度为50-750 m M,p H 6.8-8.8条件下都能有效切割靶RNA。McAgo对引导RNA(g RNA)的5′端首位碱基没有明显的偏好性;McAgo能在30-61℃范围内切割RNA,最适温度为42℃;圆二色谱分析表明,g RNA与McAgo形成的二元复合物的热稳定性相比于空的McAgo提高,熔解温度(Tm)从48.8℃提升到58.5℃;McAgo能使用12-30 nt长度的g RNA来切割靶RNA,g RNA的长度为20 nt和21 nt时切割效率最高;McAgo具有单碱基专一性并且是一个多转换数的酶。综上McAgo具有潜在的应用价值,例如以McAgo为核心开发高灵敏度的核酸检测方法,以及作为RNA水平调控工具等等,McAgo蛋白质的发现和生化性质的探究为基于Ago蛋白质的应用提供了新的可能性。
其他文献
首先,通过文献分析法对国内外关于旅游容量的概念、指标体系、评价标准、测算方法以及管理运用等方面的学术成果进行归纳总结发现:在研究区域方面,学者主要针对自然资源型景区展开了大量的研究,对人文古迹类景区研究较少。在旅游容量量化研究方面,至今未形成能够准确测算旅游地容量的规范。在旅游容量预警方面,随着游客分时段预约制度的出现,以往的研究成果已不适合当前的景区管理;其次,为弥补现有旅游容量研究的不足,本文
随着生态位理论、计算机科学、统计学模型等科学的发展,有效地结合各类环境变量预测物种在地理空间上的分布成为了可能,各种各样的物种分布(生态位)模型的应用而生,在农业生态等领域研究当中应用也越来越广泛,它们常被用来模拟物种生态位与环境间的相互关系。本文基于增长极理论,依靠核心特色产业带动区域的发展,进而辐射带动更大区域的特色农业产业布局,逐步形成融合格局,力图为农民增收创收的聚力发展,同时对物种资源生
捕食是驱动猎物形态和行为防御演化的强大自然选择压力。为了逃避捕食者的捕食,圆网蛛也演化出了多种防御策略。到目前为止,几乎所有的金蛛属蜘蛛都用显眼的白色、并能反射紫外光的蛛丝来装饰它们的圆网,这种蛛丝装饰物简称装饰带。自从装饰带在一个多世纪以前被首次发现并描述以来,生物学家就对它们的功能赋予了极大的兴趣,因此提出了多个有关蛛丝饰带功能的假说。其中的一个很重要的功能是金蛛的蛛丝装饰带是用来防御捕食者捕
植食性昆虫与寄主植物存在长期的协同进化,植物病毒的出现给二者带来更为复杂的影响。研究表明,植物病毒可以影响植食性昆虫取食行为。杀虫剂是目前最有效的防治植食性害虫的措施,但杀虫剂往往存在特异性低以及环境污染等问题,选择低毒环保的杀虫剂控制害虫及其所携带病毒的传播就显得十分重要。烟粉虱Bemisia tabaci(Gennadius)是一种世界性分布的入侵害虫,通过其口针在植物体内进行刺探取食,为害6
随着卫星遥感技术的发展,各类星载传感器已能为地理国情监测、农情监测、安全预警、定位导航等行业和大众应用提供充分的数据支撑。其中,光学遥感卫星数据由于其具有时空分辨率高、地表覆盖信息丰富的特点,受到了越来越多的关注,应用需求日益提升。然而,光学遥感传感器在采集影像数据时受大气中云层影响,存在地物信息被遮挡的情况,致使光学遥感影像数据质量降低,从而影响数据的行业化应用。因此,研究光学遥感影像中存在的云
脂肪酶具有广泛的底物选择性,以及底物特异性,它可以在温和的条件下反应,耐有机溶剂,而且不会产生过多的副反应,在工业上得到了广泛的运用。但是游离的脂肪酶使用成本高,不易回收,并且酶在生产纯化中也较为复杂。将酶展示在细胞表面的技术很好的解决了这一个问题,展示在细胞表面的酶不需过多的纯化步骤且容易回收利用,而酵母细胞的个体大,展示酶的数量也会相应增多。来源于大肠杆菌的小肽CL7是大肠杆菌素E7(CE7)
中药新药研发是一项系统工程,涉及多学科的知识和技术方法,并以产业化生产和临床应用为最终目的。自1985年我国施行新的药品注册审评办法以来,我国新药研发及其注册管理经历了30余年的发展过程,也取得了显著的成效。近年来,国家对中药新药研发给予高度重视,预示了新的发展时期的到来。中药新药研发有其自身的特点,应遵循自身的客观规律。基于多年新药研发实践,以中医理论为依据,以"有效性"为核心,以物质为载体,以
细胞自噬是生物进化中高度保守降解系统,广泛存在于哺乳动物细胞、植物细胞和酵母细胞中。细胞自噬是细胞维持稳态的重要途径,与细胞其它生命活动存在着复杂而紧密的联系。细胞可以通过多种途径调控自噬水平,包括信号通路调节、翻译后修饰调控和转录调控。其中,在转录水平上调控自噬研究较少。近年来研究证明,表观遗传修饰调控细胞自噬相关基因表达是一种非常重要的自噬调控途径。组蛋白修饰作为一种重要的表观遗传修饰类型,其
群落构建机制是生物地理学和生态学领域的核心议题之一,其研究可为全球及区域物种多样性的保护提供重要参考,对生物多样性保育和可持续利用具有重要意义。尽管有大量关于植物构建机制的研究,并发现生态位理论(环境筛选作用)和中性理论(扩散限制作用)能较好地解释植物群落构建机制,但这些研究主要集中在陆生植物群落,而湿地植物群落的相关研究相对较少,且从陆生生态系统得出理论是否适用于湿地生态系统仍存在争议。本研究以
泥炭藓因具有较高的商业价值而被大量开采,加之全球气候变暖,特别是夏季伏旱气候的影响,泥炭藓湿地遭受干旱胁迫,导致亚热带山地泥炭藓湿地遭到严重破坏,人工种植泥炭藓以恢复泥炭藓湿地及加速泥炭藓繁殖成为可供选择的途径。目前植物生长调节剂对亚热带山地泥炭藓湿地的优势物种—大泥炭藓(Sphagnum palustre L.)生长影响的研究仍少有报道。本研究以亚热带山地大泥炭藓(Sphagnum palust