本文首先介绍了对新型合作医疗制度进行研究的目的及意义，评述了国内外研究现状，在对新型农村合作医疗的相关概念界定和理论基点进行阐述的基础上，回顾并反思了我国传统农村合作医疗的发展历程，指出了传统合作医疗丧失保障功能的五个重要因素：社区组织资源的缺失、保障水平低、政府对农村医疗保障政策偏差、财政体制改革后地方财力下降、农村医疗人才的城市流向。 其次，重点分析了我国新型农村合作医疗的发展状况与绩效。新型农村合作医疗制度运行以来，覆盖面大幅增加，在财政加大支持力度下筹资水平上升，参合农民就医费用补偿得以提高，管理制度逐步完善；并且实践中进行了运行模式探索。效应显著：农民对新型农村合作医疗的认可度不断提升；农民医疗服务利用率提高，部分地缓解了因病致贫问题；新农合带动了基层医疗卫生机构的发展；制度框架和运行机制初步形成，各项管理制度不断完善，一个覆盖农村人口的医疗保障体系基本建立。随后，以广东省的新型农村合作医疗实践为例，实证分析了新型农村合作医疗绩效--农村医疗保障制度基本建立，促进了农村医疗资源的有效利用，新农合发展促进广东省农村社会福利与保障水平显著增加。并在对广东省云浮市新型农村合作医疗状况进行实地调研基础上，分析了其绩效与制度性创新。 然而，我国新型农村合作医疗发展中还存在诸多制约因素：新型农村合作医疗的运作模式制约可持续发展；尚未建立起稳定、长效的筹资机制；实施管理费用严重不足；对定点医疗机构缺乏制度性约束；对农村特殊群体的医疗保障欠公平；乡镇卫生院的服务能力薄弱；制度实施缺乏有效的法律保障。在借鉴发达国家与部分发展中国家医疗卫生保障实践经验与启示的基础上，提出了新型农村合作医疗制度的完善对策：基于农民生病就医逻辑的住院统筹与门诊统筹相结合的医疗模式创新；进一步完善新农合运行机制，包括稳定、长效的筹资机制、激励相容的补偿机制、公开透明并由参合农民参与背书的监督管理机制；构建多层次的医疗保障体系；以医疗资源倾斜政策加快农村医疗卫生基础设施建设；建立健全新型农村合作医疗的有关法律法规。