【摘 要】
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【目的】:本研究旨在筛选在神经母细胞瘤中可能与自发消退相关的长链非编码RNA,同时探索其对神经母细胞瘤细胞生物学行为的影响,并初步探讨相关机制。【方法】:本研究选取公共数据库(GEO)中的神经母细胞瘤(neuroblastoma,NB)组织标本基因芯片(GSE16476,n=88),采用R语言及BRB-Array Tools对芯片数据进行分析,得出在4期和4S期之间显著差异表达且与生存显著相关的l
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(编号:81702472)“长链非编码 RNA LINC01296对神经母细胞瘤自发消退的影响及其机制研究”;
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【目的】:本研究旨在筛选在神经母细胞瘤中可能与自发消退相关的长链非编码RNA,同时探索其对神经母细胞瘤细胞生物学行为的影响,并初步探讨相关机制。【方法】:本研究选取公共数据库(GEO)中的神经母细胞瘤(neuroblastoma,NB)组织标本基因芯片(GSE16476,n=88),采用R语言及BRB-Array Tools对芯片数据进行分析,得出在4期和4S期之间显著差异表达且与生存显著相关的lnc RNA。将其同MYCN基因扩增共同进行多因素COX比例风险模型生存分析,选出对生存预后具有独立影响因素的lnc RNA,同时分析目标lnc RNA表达水平与生存、进展、MYCN扩增、年龄及INSS分期的关系。使用GSEA对目标lnc RNA表达水平相关的功能基因进行KEGG信号通路及GO生物学功能的富集分析,探索目标lnc RNA在NB中的生物学功能。通过细胞实验和动物实验探索目标lnc RNA对NB细胞生物学行为的影响。【结果】:本研究通过对88例NB组织标本基因芯片进行分析,得出LINC01296既在4期/4S期之间显著差异表达又与生存显著相关,且为生存预后的独立影响因素。LINC01296的表达水平在存活组显著低于死亡组;非MYCN扩增组显著低于MYCN扩增组;未复发及进展组显著低于复发或进展组;年龄小于18个月组显著低于年龄大于18个月组;4期显著高于4S期;总体生存率LINC01296低表达组显著优于高表达组;无复发生存率LINC01296低表达组显著优于高表达组。LINC01296作为判断生存与死亡的指标准确性较高(敏感性=0.909;特异性=0.782),曲线下面积(AUC)=0.91。细胞实验结果显示:LINC01296可抑制NB细胞的凋亡及分化,同时可促进NB细胞的克隆形成能力及侵袭能力。动物实验结果:LINC01296可以促进神经母细胞瘤的成瘤和转移能力。【结论】:LINC01296在4期/4S期NB之间显著差异表达,与生存预后显著相关,且为独立于MYCN扩增的危险因子。LINC01296高表达的NB患者预后较差。实验结果显示LINC01296可以抑制神经母细胞瘤细胞凋亡、分化,促进神经母细胞瘤的成瘤和转移能力。以上结果提示LINC01296可能抑制了NB自发消退现象。
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