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小麦是世界上重要的粮食作物,选育高产节水小麦品种是当前小麦育种的主要任务。本研究以134个小麦品种/系为材料,利用高通量SNP芯片,进行小麦产量性状和抗旱性的全基因组关联分析,发掘重要性状的QTL及其分子标记,对小麦分子标记辅助育种及基因克隆具有重要意义。主要结果如下:(1)利用小麦90K SNP芯片对包括134个品种/系的自然群体进行扫描,在得到的多态性SNP中去除最小等位基因频率(MAF)小于5%、缺失率大于15%的SNP,剩余9329个SNP。其中,85.24%(7952/9329)的SNP有遗传位置信息,分布在21条染色体上。群体结构分析结果显示,将134个品种/系分为两个亚群,分别包括121个品种/系和13个品种/系,群体的LD衰减距离约为13 cM。(2)在成株期,将试验材料在2年、3点、2种水分处理共12个环境下种植,调查了产量相关的11个表型性状;在苗期,进行了2次PEG-6000模拟干旱胁迫试验,调查了10个表型性状。相关分析结果显示,产量性状间存在明显的相关性,产量性状和抗旱系数间存在不同程度的相关性,不同抗旱系数间也存在相关性。(3)本研究用株高、产量和产量三要素(千粒重、穗粒数和每平方米穗数)的抗旱系数作为评价小麦品种对干旱敏感程度的指标,以鲁麦21作为抗旱性评价的对照品种。经过抗旱性评价,有31个小麦品种/系表现稳定抗旱,分别是:品资旱36192,衡0628,冀5265,石4185,石家庄8号,石新618,洛旱24,洛旱8号,漯珍一号,豫麦49,周黑麦1号,加拿大超强筋麦,淮麦16,LS4942,BSS,德选1号,贵农35选21/USSR-22,济麦20,济麦21,济宁16,鲁麦23,山农1186,山农紫麦1号,山融3号,泰山21,鑫289,烟农836,临麦6号,黑小麦76,临旱822,川35050。(4)关联分析检测到999个SNP与小麦产量及产量相关性状性状和抗旱系数(DC)显著关联的,可解释表型变异的5.63~26.43%,816个SNP有遗传位置信息,分布在21条染色体的453个位点,其中贡献率大于10%的SNP有236个。共检测到740个QTL,单一QTL解释表性变异的6.15%~26.43%,贡献率大于10%的有154个。在正常及干旱胁迫下均表达的QTL有69个,其中有位置信息的有43个。