【摘 要】
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本研究采用三种方法分离了39个苎麻微卫星序列,用Primer Premier5.0设计了39对微卫星引物。选取26个自交系亲本组配了28个杂交组合,调查了亲本与F1代的主要农艺性状并分析了它们的相关性。并用30对引物分析了26个亲本的分子遗传距离,分析了遗传距离与杂种优势的相关性。主要结果如下:1)利用EST数据库搜索开发SSR引物。搜索NCBI中苎麻EST数据库,从125条EST序列中筛选得到8
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本研究采用三种方法分离了39个苎麻微卫星序列,用Primer Premier5.0设计了39对微卫星引物。选取26个自交系亲本组配了28个杂交组合,调查了亲本与F1代的主要农艺性状并分析了它们的相关性。并用30对引物分析了26个亲本的分子遗传距离,分析了遗传距离与杂种优势的相关性。主要结果如下:1)利用EST数据库搜索开发SSR引物。搜索NCBI中苎麻EST数据库,从125条EST序列中筛选得到8条含SSR序列,根据所得序列设计了8对SSR引物。2)利用ISSR技术结合抑制PCR和反向PCR开发SSR引物。使用10条ISSR引物,对基因组DNA扩增后片段测序,利用抑制PCR和反向PCR进行染色体步行。利用抑制PCR开发引物10对,反向PCR开发引物9对。3)采用AFLP扩增与磁珠富集相结合的方法,AFLP预扩的片段加接头和生物素标记的探针(AC)15杂交,用磁珠富集含微卫星序列的DNA片段,得到微卫星序列文库,用PCR法对文库进行筛选,选出25个克隆测序,得到20对SSR引物。4)用开发的30对SSR引物分析26个自交系亲本的遗传距离,运用SAS8.0对遗传距离与F1代的产量与品质性状进行相关分析,结果表明,它们之间没有显著的相关性。
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TILLING技术在鉴别自然存在的突变体有巨大潜力。本研究立足于改良较高通量的TILLING检测技术,以粳稻品种日本晴为参照,对95份栽培稻品种的miRNAs及其启动子序列进行扫描,力图获得与水稻主要农艺性状特别是抗旱性相关的等位基因。主要结果如下:1、根据抗旱性强弱,从148份栽培稻中选出92份材料,加上3份深水稻,合计95份材料进行TILLING分析;从392个标记中筛选获得多态性标记128个
以cDNA文库为基础的ESTs(Expressed Sequence Tags,表达序列标签)技术是一种快速地进行基因功能分析及发现新基因的有效方法。为了开展识别和分离开花相关基因研究,本文构建了中棉所36花发育期均一化cDNA文库,并以该文库为材料进行大规模的3’端EST测序和生物信息学分析。本研究获得的主要结果如下:1.采用本实验改良的CTAB法从中36花发育各种形态花器官中提取总RNA,混合
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从NCBI数据库下载64,566条甘蓝型油菜EST,用SSRPrimer搜索得到含SSR长度≥18bp的二核苷酸到五核苷酸重复的EST有1200条。用CAP3拼接这1200条EST序列得到130个contigs和821个singlets,共计951条序列。我们用这951条序列设计了995对引物,共含1020个SSR,包括0.3%单核苷酸重复,30.8%二核苷酸重复,55.9%三核苷酸重复,6.4%
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