论文部分内容阅读
黄瓜(Cucumis sativus L.)是我国的重要蔬菜作物,培育高产、优质、多抗的新品种是黄瓜育种者的共同目标。分子标记辅助选择(MAS)育种技术的应用,极大地加速了育种进程。而高效的MAS技术依赖于饱和的遗传图谱和农艺性状的准确定位,因此,黄瓜饱和遗传图谱的构建和性状准确的QTL定位越来越被重视。本研究以黄瓜野生变种PI 183967(Cucumis sativus L. hardwickii)和新泰密刺选系931为亲本,建立了包含179个单株的F2分离群体,利用SSR标记技术,构建了一张较饱和的黄瓜SSR遗传图谱,并结合对F2群体及F2:3家系主要农艺性状的调查结果,对黄瓜瓜长、瓜瘤大小、瓜刺密度、瓜纹密度、第一分枝节位、第一雌花节位进行了QTL定位分析。具体结果如下:(1)利用来源于黄瓜全基因组序列的2112对SSR引物,对亲本进行筛选,得到996对有多态性的引物,多态率为47.2 %,结合本所已经发表的黄瓜SSR高密度遗传图谱,对996对多态性引物进行有目的性地选择,挑选出319对SSR引物,以包含179个单株的F2群体为作图群体,构建了野生黄瓜SSR遗传图谱,该图谱包含234个SSR标记、7个连锁群,图谱覆盖基因组长度829.7 cM,平均图距3.5 cM,标记分布均匀,不存在较大的间隙。与黄瓜高密度遗传图谱进行比较后,确定了7个连锁群与黄瓜7条染色体的对应关系。(2)分别对F2群体及F2:3家系的瓜长、瓜瘤大小、瓜刺密度、瓜纹密度、第一分枝节位、第一雌花节位进行了调查,利用本研究构建的SSR遗传图谱,对这些性状进行了QTL定位研究。共检测到19个QTLs(F2代9个,F2:3家系10个),其中,瓜长检测到的QTLs最多,为5个;瓜刺密度fsd6.2的贡献率最大,为32.5%;每个性状都至少能检测到1个贡献率大于10%的主效QTL位点,共检测到主效QTL位点12个;存在不同性状QTL聚集的现象,如fmd1.1和fws1.1均定位在了1号染色体的SSR16671(65.2cM)～SSR15739(74.5cM)之间、第一分枝节位QTL flbn1.2和瓜纹密度QTL fmd1.2均定位在1号染色体的SSR12719(125cM)～SSR04986(134.8cM)之间;存在高效稳定的QTL位点:fsd6.1和fsd6.2,结合与其紧密连锁的SSR标记(SSR15802和SSR17133),可将其用于黄瓜的分子辅助育种。本研究构建的黄瓜SSR遗传图谱上有148对标记与已发表的黄瓜高密度图谱上的标记不同,结合已经发表的高密度图谱,可以构建一张更为饱和的、定位了相关性状的遗传图谱;同时确定了连锁群和染色体的对应关系,本研究第一次实现了将黄瓜主要农艺性状(瓜长、瓜瘤大小、瓜刺密度、瓜纹密度、第一分枝节位、第一雌花节位)的QTL定位到染色体上,从而为黄瓜分子标记辅助育种提供了直接的依据。