大肠埃希菌micC启动子相关性研究

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenchengDelphi
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目的micC是一种编码小分子非编码RAN(small non-coding RNA, sRNA)的基因,存在于多种革兰阴性细菌基因组内。micC位于E.coli基因组ompN与ybdK基因之间,其中ompN与ybdK转录方向一致,而与micC转录方向相反。micC启动子位于ompN与micC基因间,长度为227个碱基对(base pair, bp)。该启动子是否具有双向转录活性还未知晓,micC的应激性表达仍有待进一步探索。本文对micC启动子的双向转录活性、micC应激性表达进行了研究。方法(1)本研究以大肠埃希菌DH5ɑ为实验菌株,用天根生物科技公司产的试剂盒提取其基因组,以其为模板,设计引物分别扩增micC基因227bp、485bp的5'侧翼序列,并分别正向、反向连接到质粒pJRS462表达β-葡萄糖苷酸酶(beta-glucuronidase,gus)报告基因的上游构建报告载体,检测携带各报告载体菌株的GUS活性。(2)在实验(1)正反向启动子都有活性的情况下,利用Red重组系统将各启动子连同gus报告基因和卡那霉素抗性基因重组到DH5ɑ基因组上,对启动子特性进行验证。(3)检测各重组菌在各种应激条件下的GUS活性,如温度、酸碱度、渗透压、抗生素、氧化应激刺激等。结果(1)250bp和500bp的DNA片段正向、反向插入到质粒gus报告基因上游后,均检测出gus基因表达,实验组GUS活性是阴性对照组的两倍以上。(2)启动子连同gus基因和筛选标记成功重组到DH5ɑ基因组上;重组菌进入稳定生长期后GUS活性大幅度提高。(3)在不同应激环境下,各重组菌gus基因表达水平不尽相同:GUS活性随着温度升高而升高,随着温度的降低而降低;GUS活性随着渗透压的增高而降低;氧化应激条件下,正向启动子诱导的GUS活性表达升高,而反向启动子GUS活性无显著变化;在pH应激下,GUS活性无明显改变。结论1.介于micC与ompN基因间的DNA序列为一个双向启动子。2.同一长度的启动子其正、反向间的转录活性没有差异。3.细菌进入稳定期后micC启动子表达大幅度提高。4. micC启动子主要受温度和渗透压刺激的调节:在温度升高时,正反向启动子表达都增高,反之都降低;正反向启动子在高渗下表达都降低。5.氧化应激促进正向启动子表达,而对反向启动子表达没有影响。6. micC启动子对pH应激不敏感,细菌可能通过其它通路应对pH刺激。
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