【摘 要】
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微小RNA(miRNA)于1993年被发现,是一类长短在18~23nt间的内源性非编码单链RNA,在各种动物、植物及病毒内均有miRNA的存在。miRNA通过调控转录后基因表达水平,介入到调控生物
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微小RNA(miRNA)于1993年被发现,是一类长短在18~23nt间的内源性非编码单链RNA,在各种动物、植物及病毒内均有miRNA的存在。miRNA通过调控转录后基因表达水平,介入到调控生物体的各个进程中,涵盖生长发育、细胞分化、生理代谢、细胞凋亡、疾病发生等过程,其在机体基因表达调控通路中的作用至关重要。在所有的稻田蜘蛛中,拟环纹豹蛛(Pardosa pseudoannulata)是十分重要的优势物种,具有体型大,生态分布范围广,捕食能力强等诸多特点,在我国稻田害虫的生态调控中起着至关重要的作用。本文使用生物信息学分析方法,将Solexa平台miRNA测序得到的结果进行相关分析,研究受到镉污染后的拟环纹豹蛛卵巢内miRNA的表达水平及其靶基因功能。具体结果如下:利用EdgeR软件对卵巢中保守和新挖掘的miRNA进行差异表达分析,共41条miRNA在4个样本中存在显著差异表达,其中已知miRNA基因40条,未知miRNA基因1条。从显著差异性表达的miRNA中选出表达量上调和下调的miRNA进行靶基因预测。共有64个EST序列被预测为可能的miRNA靶基因。分别将上调与下调的miRNA靶基因进行基于Blast2go软件功能分析,结果表明:miRNA靶基因KEGG分析结果显著富集于MAPK信号通路和PI3K/Akt信号通路相关位点。结合已有的相关研究,拟环纹豹蛛卵巢内的miRNA不直接调控与卵黄蛋白合成相关基因的表达,而是通过PI3K-Akt信号通路影响卵黄蛋白的合成;同时可能通过MAPK信号通路影响了雌蛛卵母细胞的减数分裂过程,导致了产卵囊率的下降。
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