喉鳞状细胞癌特征性microRNA表达谱的研究

来源 :中国协和医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cmm870811
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占人类基因1%的microRNA (miRNA)几乎调节着至少30%的mRNA,它们通过调控相关靶基因mRNA的表达水平影响肿瘤细胞的表型。喉癌是最常见的头颈部恶性肿瘤,也是仅次于肺癌的呼吸道第二高发癌。目前,尚少见有喉癌的miRNA特征性表达谱或与其生物学行为相关的差异表达miRNA的研究报道。本项研究采用基于基因芯片技术的miRNA表达谱的分析方法,分别以福尔马林固定石蜡包埋(formalin-fixed and paraffin-embedded, FFPE)组织和新鲜冻存组织为研究材料,以获得喉鳞状细胞癌特征性的miRNA表达谱型;进而筛选出与喉鳞癌生物学特征密切相关的差异表达miRNA。同时比较从FFPE和新鲜冻存两种组织材料中所获得的喉鳞癌miRNA表达谱的差异,评价FFPE组织miRNA表达谱分析的有效性和可行性。这项研究的远期目标为,从上述“分子变化谱型”中筛选出具有鉴别意义的miRNA,对喉癌发生与发展、淋巴结转移或复发风险进行评估预测,以辅助诊断和指导治疗。首先,应用Agilent公司的人类miRNA芯片,针对24例喉鳞癌FFPE组织样品以及8例新鲜冻存的喉鳞癌患者配对癌组织和癌旁组织样品的总RNA进行了miRNA表达谱检测。继而,采用基因芯片分析软件GeneSpring和统计学软件R project分析了上述miRNA芯片的实验数据。结果显示,从24例喉鳞癌FFPE织标本中鉴定到319个miRNA,其中96个miRNA在全部24例中均有表达;从8例喉鳞癌新鲜冻存癌组织标本中鉴定到342个miRNA,其中161个miRNA在全部8例中均有表达;从而初步获得喉鳞癌的miRNA表达谱。在FFPE组织中检测到的319个miRNA信号中有233个也能在新鲜冻存喉癌组织中检测到;在FFPE组织中检测到的79个与淋巴结转移相关(p<0.05)的miRNA中有16个也在新鲜冻存喉癌组织中发现的与淋巴结转移相关的52个miRNA中出现,这16个miRNA包括miR-17、miR-130b、miR-183、miR-30b、miR-20a、miR-96、miR-188-5p等;从而确认了上述FFPE组织miRNA表达谱分析的有效性。进而采用检错率FDR<0.05进行校正,以筛选FFPE组织样品中显著差异表达的miRNA,获得5个与喉鳞癌淋巴转移密切相关的差异表达miRNA:miR-23a*、miR-28-5p、miR-15a、miR-16和miR-425。本项研究表明,具有不同生物学行为的喉鳞癌之间存在miRNA的差异表达,miR-23a*、miR-28-5p、miR-15a、miR-16和miR-425与喉鳞癌淋巴转移密切相关,有望通过进一步扩大样本的深入研究建立起能够起到鉴别或评估预测作用的分子模型。而医院病理科存档的FFPE组织可以提供符合基因芯片分析质量要求的miRNA,是研究miRNA的重要样品资源。
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