探究肿瘤相关基因GIPC2的表达调控机制

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nikun0081
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研究背景:目前在结直肠癌和恶性黑色素瘤中发现了GIPC2的外显子突变,在胃癌中发现了GIPC2表达上调,相反在肾癌、血癌和肾上腺皮质瘤GIPC2表达下调;31例白血病中发现29例GIPC2的启动子区高甲基化。这些结果都提示GIPC2可能与肿瘤的发生发展相关。研究材料和方法:本研究主要通过构建人和大鼠GIPC2翻译起始位点ATG上游2000bp序列的一系列不同长度截短片段插入至Basic-pGL3多克隆位点的重组质粒,转染到HEK293、HEK293T和PC12等细胞中检测不同长度截短片段所表现出来的转录活性。包括利用1)Vista比对不同物种GIPC2基因编码区和非编码区序列,得到GIPC2同源序列;2)分别构建插入人和大鼠GIPC2翻译起始位点ATG上游不同长度截短片段的重组质粒,转染人HEK293T细胞和大鼠PC12细胞;3)根据报告基因荧光强度推断人和大鼠GIPC2的核心启动子区;4)将人GIPC2内含子区同源序列置于核心启动子前面,构建重组质粒,转染HEK293T,HT-29和PC12细胞,检测转录活性;5)将人Human-40与Human-30之间保守碱基突变和大鼠Rat-S8与Rat-S11之间最保守碱基单核苷酸突变和次保守碱基突变,构建成重组质粒转染HEK293T口PC12细胞;6)将大鼠Rat-S8、Rat-S11和Rat-S14转染αt-KG处理HEK293T和PC12细胞,检测a-KG对GIPC2的调控作用;7)提取5’aza处理的HEK293T口PC12细胞mRNA, Q-PCR检测5’aza对GIPC2的调控作用。8)体外甲基化人和大鼠l3IPC2第一个外显子,放在核心启动子前面,构建成重组质粒转染PC12细胞,检测甲基化对GIPC2第一个外显子的调控作用。研究结果:生物信息学分析发现GIPC2在各个物种中非常保守,哺乳动物氨基酸序列和编码区序列同源性大于80%;确定了人和大鼠GIPC2核心启动子为+32至+190序列区域;人和大鼠GIPC2 ATG上游一段同源序列有抑制GIPC2启动子活性的功能;人和大鼠GIPC2第一个内含子内的同源序列有促进启动子活性的功能;人和大鼠GIPC2第一个外显子具有促进GIPC2启动子活性的功能,但是甲基化后促进启动子活性的功能消失;α-KG可作用于Rat-S8与Rat-S11之间的序列,使得这段序列的抑制启动子功能消失;5’aza处理HEK293T和PC12细胞后,发现GIPC2表达量升高100多倍。研究结论:本研究确定了GIPC2的核心启动子区域。在非编码区域找到了一系列潜在的顺式作用元件能够调控GIPC2的表达。发现GIPC2第一个外显子具有调控GIPC2表达的功能。
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