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目的比较不同检测方法对手足口病(HFMD)病原体的检出能力,分析HFMD重症患儿与轻症患儿在病原体感染和实验室检查上的差异；了解近年来杭州市引起HFMD优势病原体的转变,研究接触人群病原体的携带率。方法1、用RT-PCR和ELISA方法分别检测疑似HFMD患儿的咽拭子或粪便标本RNA和血清标本IgM抗体,分析两种方法检测能力的差异；2、用RT-PCR检测849例疑似HFMD患儿的病原体,对确诊HFMD患儿的年龄、性别及轻症、重症HFMD分布情况进行描述。3、对HFMD重症和轻症患儿的脑脊液(CSF)进行生化、常规、IgM和RNA的检测,分析组间差异。4、将与EV71重症组的接触人群依据亲密程度分入亲密接触组、一般接触组和医护接触组,检测粪便标本肠道病毒RNA,调查不同接触人群的病毒携带率。结果1、RT-PCR与ELISA方法对肠道病毒EV71和CVA16感染的检出率未见显著性差异(P>0.05)。2、疑似HFMD患儿中,641例确诊为肠道病毒感染,男女患儿比例1.4：1,1～3岁患儿占80.3%。重症患儿150例,轻症患者491例,EV71、CVA16和其他肠道病毒分别占24.3%、4.7%和71.0%。75.6%的EV71感染表现为重症HFMD,与CVA16和其他肠道病毒引发重症HFMD有显著差异(P<0.05)3、HFMD重症组CSF微量总蛋白显著高于轻症组(P<0.05)。EV71重症组CSF有核细胞增加以中性粒细胞为主,而非EV71重症组和EV轻症组则以淋巴细胞增高为主(P<0.05)。EV71重症组的脑脊液的EV71-RNA均为阴性,EV71-IgM阳性率为69.1%(38/55)。4、密切接触组和一般接触组之间感染率未见显著差异(P>0.05)。结论1、RT-PCR与ELISA方法对EV71和CVA16的检出率较为一致；2、EV71是引起HFMD重症的主要病原体；3、重症与轻症HFMD脑脊液在微量总蛋白和有核细胞的升高类型上有差异,可辅助判断预后；4、2013年杭州市HFMD优势病原体已从2011、2012年的EV71转变为非EV71非CVA16肠道病毒；5、肠道病毒传染性与接触的亲密程度无关,与做好个人卫生和防护有密切关系。