苜蓿因为其具有较高的生物量和蛋白质含量,所以在全世界被广泛种植。在我国,随着畜牧业生产的不断发展,集约化草牧业受到了极大的重视,对优质牧草的需求日益增加。苜蓿作为“牧草之王”被众多育种研究者与分子生物学研究者所重视,无论是从表型、生理还是在分子水平上,对苜蓿的认识都在逐步深入。本文以46份苜蓿种质为材料,从农艺性状、抗旱与抗寒性、SSR分子标记等3个方面进行了其遗传多样性鉴定与分析,结果如下:首先以44份苜蓿种质为材料,通过对株高、茎粗、生殖枝数等共14个农艺性状进行测定,并对14个农艺性状进行方差分析、主成分分析、相关性分析以及聚类分析,综合评价表明材料M1等20份材料在株高、种子产量、每花序荚果数、荚果直径、荚果宽、每荚果种子数上表现较为突出,这类材料的植株特点为植株高,种子产量高,每花序的荚果数多,荚果大且每荚果的种子数多,在育种应用过程中适宜优先考虑。以46份材料的越冬率评价抗寒性,4份材料的抗寒能力较差,其中有M8与M9没能越冬,M19与M29的越冬率较低;M7等共9份材料的抗寒能力较低;M1等共21份材料的抗寒能力中等偏上;材料M5等共12份材料抗寒能力较强。对其中的36份材料进行PEG胁迫处理,通过测定种子萌发期的发芽率、相对发芽率、发芽势、相对发芽势、发芽指数、相对发芽指数、抗旱指数以及叶绿素含量,综合评价分析后,将36份材料分为5级,M2等6份被划分为第1级,抗旱性强。材料M4等10份材料被划分第2级,抗旱性较强;M1、M8为第3级,抗旱能力中等;材料M17等12份材料被划分为第4级,抗旱性较弱;材料M21等6份材料为第5级,抗旱性较差;且苗期叶绿素含量与萌发期干旱胁迫响应不一致。对44份苜蓿种质材料进行SSR分子标记测定,13对SSR引物共扩增出120条扩增带,平均每对引物具有9.23条扩增带。在120条扩增带中有102条具有多态性,每对引物的多态性条带数范围在3-20条,平均每对引物具有7.85条扩增带,多态位点百分比为85%。Nei基因多样性指数的变异范围在0.1116-0.4331之间,平均值为0.2929。Shannon信息多样性指数的范围在0.1962-0.6229之间,44份材料间的相似系数范围在在0.5417-0.8333之间,其中介于0.5417-0.5917之间的材料有14对,占总体的1.48%,这14对材料间的亲缘关系较远;相似系数在0.6083-0.6917之间的材料有499对,占总体的52.75%。相似系数在0.700-0.7917之间的材料有414份对,占总体的43.76%,介于相似系数0.800-0.833之间的材料有19对,占总体的2.01%,材料间的亲缘关系较近。可见44份材料遗传多样性较丰富,种群分化程度较高,材料间丰富的遗传多样性,为今后的育种工作提供参考依据。本研究采用田间与室内试验相结合的方法通过对46份苜蓿种质材料田间表型与农艺性状、室内抗寒与抗旱性鉴定揭示不同苜蓿种质材料的遗传多样性和遗传差异,在此基础上通过微卫星标记在分子水平上进行更加深入的探讨,揭示不同苜蓿品种之间的遗传差异与亲缘关系,为筛选优异苜蓿种质材料、培育优良苜蓿新品种奠定重要研究基础。