禽流感病毒在侵染宿主细胞后所产生的dsRNA会迅速激活dsRNA依赖性的蛋白激酶PKR，被激活的PKR会将真核翻译起始因子eIF2α磷酸化，造成整个细胞的蛋白合成的停止，从而起到抑制病毒复制的目的，这是干扰素系统抵御病毒入侵的重要方式之一。然而随着高致病性禽流感的广泛流行，研究发现高致病性毒株在干扰素耐受性上要明显强于低致病性毒株，近期的一些研究表明禽流感病毒非结构蛋白NS1在此过程中起到了重要的作用，NS1蛋白能与PKR高效的结合并进一步干扰其作用功能，影响PKR底物eIF2α的磷酸化水平从而破坏宿主免疫系统对病毒蛋白合成的控制。但目前对于NS1蛋白与PKR的具体作用机制研究领域还存在着很大的争议，通过对大量不同流感病毒毒株NS1蛋白序列的比对发现其N端1-73位的氨基酸序列保守程度较高，这段序列主要行使dsRNA结合的功能，而NS1的C端则存在着较多的变数，由于C端的不稳定性以及不确定性致使现在对于NS1蛋白在与PKR的具体相互作用过程中所发挥的作用仍然不太明确。　　 在本课题的研究中，我们的研究目的即是试图通过比较不同毒性毒株的NS1蛋白对PKR影响的差异来找出产生这种差异的原因，进一步解读NS1蛋白与PKR相互作用的具体机制，从而基于对这种机制的理解能够在禽流感治疗以及相关药物开发上产生指导作用。基于上述思路，我们构建了一整套基于生物化学方法的酶活性体外检测平台，包括作为激酶的PKR、作为底物的eIF2α的表达纯化，以及用作检测的来自不同毒性毒株的NS1蛋白的表达纯化，通过适宜的酶反应体系利用western-blot检测PKR底物eIF2α的磷酸化程度，我们发现不同毒性毒株的NS1蛋白对于PKR括性的抑制存在很大的差异，进而通过SPR的手段精确检测了来自不同毒性毒株的NS1蛋白与PKR的结合能力，检测结果表明尽管不同的NS1蛋白对于PKR激酶活性的抑制能力差别很大，但是不同NS1蛋白对于PKR的结合能力差异却并不明显，这个结果使我们做出一个假设，即NS1蛋白是先与PKR高效结合然后通过其调节域来抑制PKR活性的，而不同毒株的毒性强弱则体现在这种抑制能力上。