支气管肺发育不良（bronchopulmonary dysplasia,BPD）是一种常见的慢性肺部疾病,以初期肺损伤为主要特征,其发生率与新生儿出生体重、胎龄呈负相关关系。随着医疗技术迅速发展,早产儿存活率提高,BPD发生率也随之升高,即使投入了大量临床和分子研究,BPD发病率仍无明显好转,这也已经成为临床上一个非常棘手的问题。BPD的发病因素主要有早产、肺发育不成熟、机械通气、遗传、感染和营养不良等多种因素,其中遗传因素占50%以上。人类可遗传变异中单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）是最为常见的一种,占已知遗传多态性的90%以上。应用全基因组关联分析（genome wide association study,GWAS）发现人类基因组1q43区域中 SNP标记rs2105146 位于中心体蛋白基因CEP1 70（centronsomal protein 170KD）的内含子区,与BPD密切相关。但GWAS也有一定的局限性,所发现的rs2105146只是标签SNP,真实致病位点往往不是标签SNP,而是与之连锁的其他位点,并且GWAS也无法揭示所发现变异的致病机制。本研究在GWAS的基础上,运用等位基因差异表达（allele-specific expression,ASE）直接确定顺式调控因素SNP对CEP1 70表达是否存在影响,通过染色质构象捕获技术、双荧光报告检测、染色质免疫沉淀技术和转录因子过表达等多种功能基因组学手段确定人类基因组1q43区域中BPD的真实致病位点和致病机制。主要结果如下:（1）利用千人基因组计划数据分析IBS（Iberian Population in Spain）群体中与rs2105146连锁的SNP位点,发现共有71个连锁SNP。进一步分析东亚人群,发现 CHB（Han Chinese in Beijing）和JPT（Japanese in Tokyo）群体也具有类似的连锁模式。这些SNP 中,rs6701379位于CEP1 70基因的3’-UTR区（3’untranslated region）,其他SNP位点均位于非编码区。（2）应用ASE分析编码区SNP rs6701379的结果显示48个肺部组织样品中有12个为杂合子个体,并且A等位基因的表达量显著低于G的表达量（P=0.000002）,表明rs6701379或与其连锁的位点可顺式调控CEP170的表达。（3）运用染色质构象捕获技术（3C-qPCR）筛选与CEP170启动子区存在相互作用的基因组片段,共发现了4个与CEP1 70存在相互作用的基因组片段,其上存在8个 SNP（rs6429410、rs12406630、rs12406654、rs200997665、rs151302646、rs75388769、rs74651335和rs1766026）,可能通过改变增强子活力影响CEP170表达。（4）通过构建pGL3-promoter-SNP重组质粒,定点突变SNP位点和双荧光报告检测等实验证明了rs1766026、rs12406654、rs200997665、rs75388769和rs151302646等5个位点是功能性突变,且这些位点位于非编码区,通过增强子模式调控基因的表达。（5）运用染色质免疫沉淀技术确定了rs1766026、rs12406654、rs200997665和rs151302646 分别位于转录因子CUX1（cut like homeobox 1）、TBX20（T-box transcription factor 20）、HNF4A（hepatocyte nuclear factor 4 alpha）和CUX1的DNA结合区域。（6）通过构建和转染转录因子pEGFP-N1过表达载体以及双荧光报告检测实验确定了转录因子CUX1、TBX20、HNF4A和CUX1过表达可以调控目标基因表达。其中TBX20对基因表达呈负相关作用,抑制基因的表达。本研究通过探讨1q43区域的SNP对BPD易感基因CEP170的调控机制,为进一步阐明BPD的发生、发展机制提供了新方向。对于新功能性位点的确定,可为BPD诊断、预防和治疗提供新的依据。此外,本研究通过应用ASE和3C-qPCR技术研究基因组功能区域,提供了一个良好的范例。