中国东北地区非综合征性唇腭裂与染色体10q25.3基因多态性的相关性研究

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实验目的:  先天性唇腭裂发病率较高,是人类最常见的先天性缺陷性疾病之一。它不仅仅表现在面部形态上的异常,还会给患者带来饮食、语言、听力、心理及社会适应能力等方面的问题。目前的医学技术,难以使患者从外貌到功能以及心理完全达到正常。因此,探究该疾病的发病机制,进而找到有效的预防手段显得十分重要。唇腭裂是一种复杂的遗传性疾病,特别是非综合征性唇腭裂,发病机制至今尚不明确,本研究选取染色体10q25.3(rs7078160)在东北地区人群中进行基因分型验证实验,探讨其与非综合征性唇腭裂的相关性。  实验方法:  随机选取东北地区78个非综合征性唇腭裂核心家系(患儿及患儿父母)、113个非核心家庭(无父、无母或无父无母)的血样标本入病例组;随机选取来自东北地区180例非唇裂儿童的血样标本入对照组。提取基因组DNA,用核酸分析仪对DNA进行定量,采用聚合酶链反应对目的片段进行PCR扩增后,2%琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物,DuRed核酸染料染色法检测,经检测合格后的产物用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)方法检测基因型,将酶切产物电泳后行银染显色观察结果。分别统计患者组个体及家庭成员和对照组个体染色体10q25.3的rs7078160基因型和等位基因,通过Hardy-Weinberg平衡检测,并用SPSS统计软件进行x2检验,计算病例组与对照组染色体10q25.3(rs7078160)的基因型及等位基因频率的差别及构成比的差别,计算相关风险值分析和95%可信区间并进行关联性的计算。对非综合征性唇腭裂完整家系进行传递不平衡检验(TDT)。  实验结果:  一、染色体10q25.3(rs7078160)的基因多态性  二、10q25.3(rs7078160)基因型及基因频率分析  (一)Hardy—Weinberg平衡检验  表1,Hardy-Weinberg平衡检验┏━━━━━━┳━━━┳━━━━┳━━━━━━━━┳━━━━━┳━━━━━┓┃基因型┃┃┃等位基因频率┃ x2┃ P┃┣━━━━━━╋━━━╋━━━━╋━━━━━━━━╋━━━━━╋━━━━━┫┃ GG┃ AG┃ AA┃ G A┃┃┃┣━━━━━━╋━━━╋━━━━╋━━━━━━━━╋━━━━━╋━━━━━┫┃病例组55┃58┃67┃168192┃┃┃┣━━━━━━╋━━━╋━━━━╋━━━━━━━━╋━━━━━╋━━━━━┫┃对照组106┃112┃136┃324384┃0.08┃>0.05┃┗━━━━━━┻━━━┻━━━━┻━━━━━━━━┻━━━━━┻━━━━━┛ p>0.05说明数据来自同一孟德尔群体。  (二)基因型在病例照组中的分布  杂合子患唇腭裂的危险性是纯和型的0.998倍。  病例组和对照组之间杂合子和突变纯和型(AG+GG)基因型患唇腭裂的危险性是纯和型的0.971倍。  (三)基因频率在病例组和对照组中的分布及OR值  未发现疾病发病的危险因素  (四)传递不平衡检验TDT  标记位点与疾病位点不连锁,不存在遗传失衡现象。  实验结论:  东北地区人群非综合征性唇腭裂与染色体10q25.3(rs7078160)的多态关联性遗传分析结果无统计学意义,复杂疾病家系关联性遗传分析结果无统计学意义。  A/G等位基因在疾病病因的研究中无统计学意义,携带AG等位基因不会增加患病风险,故父母传递给子代的A/G等位基因代的患病无作用。
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