IFNL3/4单核苷酸多态性与艾滋病患者HAART治疗应答的关联性研究

来源 :广西中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaofyk
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目的:为研究IFNL3/4基因多态性对艾滋病患者高效抗逆转录病毒治疗(HAART)应答疗效的影响,本研究通过检测艾滋病患者IFNL3/4基因位点rs28416813、rs12971396和rs4803221基因型,比较三个位点不同基因型频率、等位基因频率在HARRT治疗应答分组中的差异,进而综合分析IFNL3/4基因位点SNPs与艾滋病患者HARRT治疗应答疗效的相关性。方法:1.本研究所有研究对象均来源于2011年1月至2020年1月期间在广西中医药大学附属瑞康医院就诊的HIV感染者/AIDS病人。根据现代医学诊断标准,按照本研究的纳入标准和排除标准,用随机抽样方法选取符合入组条件的HIV感染者/AIDS病人共137例。采集患者临床资料和外周抗凝血,提取基因组DNA。使用Oligo 7 Primer软件给每个位点设计特异性外引物,采用两对引物-聚合酶链式反应(PCR-confronting two-pair primers,PCR-CTPP)检测IFNL3/4 rs28416813、rs12971396和rs4803221等位基因,选取5%的PCR-CTPP阳性扩增产物进行纯化,并外送测序,测序结果通过Bio Edit软件与原始基因序列比对分析以确定基因型。2.按照《中国艾滋病诊疗指南(2021年版)》关于免疫学治疗有效疗效评价标准,将HAART治疗1年后CD4+T细胞数比基线增加100个/μL归为免疫应答有效组,反之归为免疫应答无效组。分析不同组间IFNL3/4位点基因型、等位基因分布情况及其与HAART治疗应答的关联性。3.运用二分类Logistic回归分析比较各因素对治疗结果的影响,计算比值比(odds ratio,OR)和95%置信区间(95%confidence intervals,95%CI);并应用SHEsis软件进行基因分型的单倍型、等位基因频率以及连锁不平衡检验分析,所有检验均为双侧,以P<0.05为差异具有统计学意义。结果:1.患者性别、年龄、基线CD4+T细胞计数、基线CD8+T细胞计数和基线CD4/CD8比值在两组间的差异均无统计学意义(男74.40%vs74.50%,P=0.991;(38.31?14.71)岁vs(40.75?15.48)岁,P=0.361;(268.06?113.13)个/μL vs(294.43?129.90)个/μL,P=0.214;(1001.41?454.31)个/μL vs(1069.49?611.26)个/μL,P=0.492;0.30?0.15 vs 0.37?0.39,P=0.211)。2.用SHEsis分析显示,IFNL3/4的rs28416813和rs12971396位点间存在高度连锁不平衡,而rs4803221和rs28416813、rs12971396两个位点处于低度连锁不平衡。3.rs28416813、rs12971396和rs4803221三个位点基因型均只检测出GC型和CC型,未发现GG基因型。在单因素分析中,rs28416813、rs12971396和rs4803221三个位点基因型与TDF+3TC+EFV治疗应答无相关性(P分别为0.628、1.000、0.534)。对性别、年龄、基线CD4+T细胞计数、基线CD8+T细胞计数、基线CD4/CD8进行校正后,rs28416813-GC、rs12971396-GC、rs4803221-CC显示与ART治疗应答无相关性(P分别为0.824、0.732、0.591)。rs28416813、rs12971396和rs4803221位点等位基因频率在有效组和无效组间无统计学意义(P分别为0.898、0.977、0.773)。4.按性别分层后的分析结果显示,无论男性还是女性,rs28416813、rs12971396和rs4803221位点在无效组和有效组间的基因型频率和等位基因频率的差异无统计学意义(P>0.05)。结论:IFNL3/4基因区域的rs28416813、rs12971396、rs4803221三个位点基因多态性与艾滋病患者TDF+3TC+EFV治疗应答无关。
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