作为机体的防御体系,体液免疫在人类战胜细菌、病毒、寄生虫及其它致病因子的能力方面起着至关重要的作用。在整个体液免疫的过程中,T细胞和B细胞处于核心的地位。通过预测T细胞识别表位以及B细胞识别表位来设计疫苗已成为免疫信息学中的热点。目前,针对T细胞识别表位的预测已取得较高的准确率,但预测出的表位多具有良好的MHC Ⅱ结合性而无良好的免疫原性；同时,对B细胞表位的预测仍未取得令人信服的结果。考虑到整个体液免疫过程中,助T细胞能够识别被MHC Ⅱ所呈递的抗原片段,从而被激活后释放细胞活素以刺激自身增殖,增值后的助T细胞释放大量白细胞介素-2(IL-2)进而促进B细胞增殖。B细胞若要分泌抗体中和抗原以起到免疫效应,必须要得到两方面的信息,即B细胞受体(BCR)所结合的抗原蛋白信息和助T细胞所释放的增殖信号。因此,有必要分析一下两种淋巴细胞识别抗原过程时的信号传导过程,确定T淋巴细胞识别抗原的方式是否对B淋巴细胞对抗原的识别产生了影响,以及两者之间是否有着信息的传递效应。通过分析MHC Ⅱ线性表位与空间表位之间的异同,可以为今后的表位预测提供新的思路。在B细胞表位预测过程中考虑线性表位的影响,从而提高其预测准确率；同时,在预测MHC Ⅱ线性表位时考虑空间表位的影响,使得预测出的表位更具有免疫原性,提高设计疫苗的有效性。