长期以来，新疆一直扮演贸易通道的角色，本地制造业却一直发展缓慢，第二产业产业结构单一，资源依赖型产业比重大等问题突出。新疆正处于跨越式发展的重要时期，产业结构急需得到优化和升级，才能带动整个国民经济加快增长，就业结构、就业环境以及人均收入才能得到改善。如何解决推动新疆制造业升级，从而推动整个产业结构升级成为关键问题。本论文依据新结构经济学方面的理论基础，出发点是分析要素禀赋结构及其决定的比较优势，目的是研究新疆制造业升级存在的问题。通过研究要素禀赋结构与经济发展和产业升级的关系，发现新疆经济发展存在的根源性问题。文章分为绪论、正文和结论三大部分。正文第一部分是运用定量和定性的方法，研究了新疆制造业和产业升级存在的问题；第二部分通过实证方法，分析阻碍新疆制造业升级的原因。首先对影响地区经济增长和产业升级的禀赋因素进行理论推演，后从产业组织层面对新疆制造业升级存在问题进行实证分析，再进行产业结构层面的研究，分析基础设施、出口与产业结构的关系及其相互影响。序言是介绍本论文的思路、相关研究综述、理论意义和实际应用意义。第二章主要是要素禀赋结构与制造业升级相关的概念与关系的理论分析，包括制造业升级介绍和影响因素与规律分析以及要素禀赋结构升级与产业升级的关系。第三章对新疆制造业发展现状进行分析。包括新疆要素禀赋结构及制造业发展过程及现状。第四章是实证分析，主要是研究要素禀赋与禀赋结构对经济发展和制造业升级的影响，包括要素禀赋结构转变对我国经济发展的影响、基础设施与新疆产业结构升级，以及新疆制造业升级存在的根源性问题研究。第五章根据分析结果提出问题解决政策。综合分析发现，新疆制造业升级的根源性问题是过渡依赖自然资源，长期忽视要素禀赋结构的改善，导致新疆制造业竞争力不强，企业面临诸多外部性问题，阻碍产业发展。这也一定程度上解释了新疆沦为贸易通道，出口对新疆经济发展拉动作用不强的原因。违背比较优势发展会导致资源过渡投入被选择产业，配置效率低下，同时技术创新受到阻碍，使其对产业升级和经济增长作用减弱。另外，违背比较优势发展方式导致业结构向单一化方向发展，产业结构偏离，结果是经济发展滞后。地区长期要素禀赋结构无法得到优化，非选择性产业面临更多的市场外部性问题。未来落后地区发展应以市场为主要基础制度，注重自身要素禀赋结构的提升，充分发挥制造业先发带动优势，加大生产性服务业等制造业配套产业扶持力度，增强制造业与配套产业的依存度，同时通过深加工、制造业服务化等延长制造业产业链，提高制造业产品附加值。对于资源垄断行业应该适当的进行管制，合理增加人力资本、基础设施、科技创新等要素的投入，促使要素禀赋结构升级，以减少经济运行的外部性问题。