党的十九大报告指出“坚定实施科教兴国战略,培养造就一大批具有国际水平的战略科技人才、科技领军人才、青年科技人才和高水平创新团队”。基于此,政府和科研教育部门想要在全国范围内通过大力投入科研经费的方式,实现科教兴国、创新治国、人才强国的战略目标。如何合理投入科研经费实现人力资本累积,从而促进科技创新,最终能够有效地提高科研产出效率,成为了当前科研项目经费治理的重中之重。纵观我国目前高校科研项目经费治理现状,采用的是政府主导的管理模式,科研经费的管理权力几乎被行政机关垄断。具体来讲,高校科研项目经费的管理主要是由政府科技主管部门及其下属的单位负责,基本实行内部化管理。在这种管理模式下,导致科研项目经费使用效率极低,科研人员的创新、研发和探索的积极性不足。同时,在行政权力主导的管理框架下,将科研人员视为与政府之间有隶属关系的公务人员,对于一些计划外的经费使用,动辄便认定是违法违规甚至是犯罪行为。这样的管理模式违背了设立科研项目经费的初衷,体现出浓厚的行政化色彩。目前多数学者认为,科研项目经费治理的本质,是国家与科研人员之间形成的科研契约关系,同时具备公法与私法属性,属于典型的经济法范畴。将比例原则引入科研项目经费治理过程中,可以更好地协调国家干预与科研自主之间的关系;能够更好地平衡社会公共利益与科研人员个人利益之间的矛盾;加快科研项目经费治理由行政主导向科研契约关系主导的转变,提升科研人员的自主性,促进科技创新。此外,比例原则的适用在实现科研纠错问责、经费使用违法违规认定等方面,便于有效区分科研风险、科研失败与科研不端、骗取科研经费之间的界限,充分尊重科研创新中潜在的风险和未知的挑战。不难看出,在科研项目经费治理中合理适用比例原则,对今后治理理念以及管理体制改革还有相关法律法规、政策意见的出台,都具有十分深刻的指导作用。本文一共分为五个部分来论述比例原则在高校科研项目经费治理中的适用:第一部分是绪论,通过回顾我国改革开放四十多年以来,国家科研项目经费治理体系改革与完善进程,阐述了文章的研究背景和研究意义,又梳理了比例原则和科研经费的相关文献。还归纳了本文的研究方法和创新之处。第二部分是正文的第一章,解释了高校科研项目经费的概念与特点,并且总结了高校科研项目经费治理的概念和特征。第三部分是正文的第二章,通过检视我国科研项目经费治理现状,提出目前我国科研项目经费治理亟待解决的问题,并且找到了治理过程中价值取向的偏颇,探讨其形成的原因以及内在、外在的表现,指明了我国科研项目经费治理的困境及其实质。第四部分是正文的第三章,首先厘清比例原则的概念及其内涵,再对比例原则适用于经费治理的可行性与必要性进行论证。第五部分是正文的第四章,深入研究了科研项目经费中最核心的三个问题,找到了比例原则在科研项目经费支出与使用、经费违法违规行为认定以及科研激励与问责三个阶段中的具体适用,提出了科研项目经费治理新模式。