辽宁绒山羊高繁候选基因SNP及其调控非编码RNA的表达分析

来源 :沈阳农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenhua99
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
繁殖性状在山羊育种中具有很高的经济价值,增加母羊的产羔数对于提高养羊业的生产效益具有重要意义。母羊的多羔基因是决定绒山羊繁殖性状的关键因素,而产羔数是一个受微效多基因控制的数量性状,其遗传力仅为0.1左右,难以通过传统的育种手段来快速提高。因此,寻找与山羊产羔数性状相关的基因和分子标记一直都是育种学家关注的焦点。本研究旨在将GDF9、BMPR-IB、FecB和ESR作为候选靶基因,分析其与潜在靶分子间的网络调控揭示它们在辽宁绒山羊卵巢组织繁殖过程中的潜在调控机制,对筛选出的高繁殖力基因的非编码RNA进行生物学分析,进而探究非编码RNA在山羊卵巢中对产羔率的影响;同时对辽宁绒山羊的GDF9、BMPR-IB、FecB和ESR基因做PCR-Seq多态性检测,通过序列比对寻找潜在的SNP,分析辽宁绒山羊GDF9、BMPR-IB、FecB和ESR基因多态性对产羔数及产绒性能的影响。获得的结果如下:1.高繁候选基因非编码RNA荧光定量PCR检测结果:本研究通过对辽宁绒山羊卵巢组织中的非编码RNA进行荧光定量PCR检测。结果显示,有14个mi RNAs均在辽宁绒山羊三胎卵巢组织中表达量低,双胎中的表达量相对较高,mir-93三胎相对表达量最低。构建了调控产羔数的ceRNA网络,得到了circ RNA-mi R34c-ESR和MSTRG.3853.4-mi R484-GDF9调控关系网,可能分别对辽宁绒山羊产羔数起正/负调控作用。2.高繁候选基因的多态性与产羔数及产绒性状的结果分析:本研究在辽宁绒山羊群体中,在GDF9、BMPR-IB、FecB和ESR基因的3′UTR区检测到多态性,共发现8个单核苷酸多态性(SNPs)位点,其中5个为有效SNPs位点(C47T、C94T、C299T、C463T和T575G)。基因型鉴定分析表明,在辽宁绒山羊群体中CC和GG基因型是双羔优势基因型;CCGG和GGCC单倍型组合是双羔优势单倍型组合;FecB C94T和ESR C463T位点的CC基因型是双羔优势基因型,对辽宁绒山羊产羔数有显著影响(P<0.01),且C等位基因与产羔数呈正相关;因此,推测FecB C94T和ESR C463T是影响辽宁绒山羊产羔数的主要SNPs。产绒性状对比分析发现,FecB C94T位点TT基因型个体平均产绒量最高,绒细最佳;BMPR-IB C47T位点CT基因型个体自然绒长最高,ESR T575G位点GT基因型个体净绒率最高;C463T位点的CC基因型对绒细有显著影响(P<0.01)。
其他文献
辽宁绒山羊是一种遗传力稳定以羊绒而闻名的品种,随着羊绒大量的流行,人们对羊绒的需求越来越高。虽然羊绒产量很高,但总体趋势是羊绒过粗,而羊绒细度起着决定性作用,是评价羊绒品质的重要指标之一。近些年,通过高通量测序和全基因组关联分析等方法已经在调控羊绒细度方面有新的进展,发现了调控羊绒细度的关键基因和关键通路,但仍未能从根本上解决调控羊绒细度这一课题。本研究从分子生物学角度出发,拟筛选出可能调控羊绒细
相信每一位在一线工作的语数老师每天都有一个任务就是批改作业,批改作业是最直接检查学生学习效果的手段之一。勾勾、叉叉,圈圈、点点……各种符号都是一种无声的语言,它们在帮
各位领导,专家,同志们:正当全国各族人民在中国共产党的领导下,万众一心,为落实国民经济和社会发展“十年规划”和“八五”计划纲要,向本世纪末宏伟目标奋勇进军的时候,中国
随着我国经济的不断发展,对建筑行业提出了更高的要求,在不损失建筑功能的前提下,要求节约材料,减少投资。由于组合结构是发挥各种材料特征和潜能的最佳结构形式,采用组合结构是节约材料、节省投资的有效途径,因此组合结构被广泛应用在各个工程领域。并且随着建筑功能的多样化,结构体系的梁构件截面尺寸逐渐增大,深梁越来越多的出现在结构体系中。外包U型钢—混凝土组合深梁作为一种新型的组合结构,有着刚度大、承载力高、
不同鼠疫疫源地的鼠疫菌所携带的质粒种类是不同的,大部分鼠疫菌通常携带规范的质粒,即携带6、45和65Mdal 3种质粒[1].最大一类质粒变异较大,而且独自规律地分布在特定的地理
科学的作业安排不仅能够将课堂延伸出去,还能够在一定程度上帮助学生强化自身对知识得消化与巩固。小学英语是我国素质教育下的重点教学科目,也是学生今后发展、学习必不可少
目的:观察MMP-7在胃癌中的表达情况及其与侵袭转移的关系.方法:采用免疫组化SP法,对38例胃癌做MMP-7、Ⅳ型胶原的抗原标记.结果:38例胃癌中MMP-7的表达阳性率为68.4%;MMP-7的
我国正处于信息技术发展的重要阶段,信息技术对我国各行各业的生存与发展产生了积极影响。在商业领域,"互联网+"已经成为企业经营的常见模式,不仅极大程度上改变了我国的市场
在医学口腔教育中融入投影、数字处理、文字、图像、声音、动画等教学方式,可使枯燥、复杂难懂的口腔基础、口腔临床及口腔制作工艺技术教学变得生动、具体、形象,让学生更全
目的:分析纤维支气管镜灌洗结合局部灌药对老年重症肺炎并肺不张患者的影响.方法:随机选取本院收治的2015年5月到2016年3月50例老年重症肺炎并肺不张患者,并依据随机数字方法,