在经济全球化和区域经济一体化的背景下，区域旅游合作是重要的发展趋势之一，成为全球性的旅游发展热点问题。区域旅游合作中，合作机制是最根本的问题，合作机制的运行状况直接关系到区域旅游合作的成功与否。传统的区域旅游合作机制的构建都是以经济学、管理学中的区域分工理论、区位论、核心——边缘理论、规模经济理论、行政区经济理论等理论作为依据的，这些理论在区域旅游合作开展初期起到了理论支撑的作用。随着区域旅游合作的开展。行政分割、资源浪费、建设重复、市场重复开拓等问题逐步显现出来了，区域旅游合作的进一步深层次的发展急需要解决这些问题。这些经济学、管理学理论的应用并没有从根本上解决这些阻碍区域旅游合作往深层次发展的障碍，这时的区域旅游合作就需要引进新的理论，充实区域旅游合作的理论基础。本文就是以生物学上的共生理论为依据，分析区域旅游合作的运行机制，以期解决区域旅游合作往深层次发展的障碍问题。 全文分为五个部分。 第一部分为概述。介绍了研究的背景和意义、本文的研究方法以及区域旅游合作和共生理论的国内外研究概况。 第二部分为相关理论。介绍了区域旅游和区域旅游合作的定义，区域旅游合作的基本理论，并分析了共生理论的基本概念、基本特征。 第三部分为区域旅游合作的共生系统分析。分析了区域旅游合作共生系统建立的共生三要素、必要条件和充分条件；区域旅游合作共生系统的特征、结构、功能、共生机制。 第四部分为长江三角洲区域旅游合作共生系统分析。在对长江三角洲区域旅游合作现状分析的基础上，分析了长江三角洲区域旅游合作系统的共生三要素、共生条件、共生机制。 第五部分为结论与展望。通过对区域旅游合作和共生理论以及实证的研究，得出生物学上的共生理论可以应用于区域旅游合作研究，并解决区域旅游合作发展中遇到的问题。 通过以上研究，本文认为共生理论适用于区域旅游合作，并且能够促进区域旅游合作机制的稳定运行。通过对长江三角洲区域旅游合作共生系统的分析，得出其区域旅游合作系统的共生机制还不完善。