【摘 要】
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松辽黑猪作为东北优良的地方品种深受养殖户的喜爱,母猪繁殖性能高低是决定养殖经济效益的关键,近年来,分子遗传标记和母猪高繁殖性状的候选基因选择的研究越来越多。本实验选取130头松辽黑猪为研究对象,旨在探究松辽黑猪NR5A2、OOEP、LHX8及OAS1基因多态性及其与繁殖性状的关联性。通过不同样品的混池,利用Sanger直接测序法查找NR5A2基因外显子的SNP位点,通过HRM分型技术分析SNP位点
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松辽黑猪作为东北优良的地方品种深受养殖户的喜爱,母猪繁殖性能高低是决定养殖经济效益的关键,近年来,分子遗传标记和母猪高繁殖性状的候选基因选择的研究越来越多。本实验选取130头松辽黑猪为研究对象,旨在探究松辽黑猪NR5A2、OOEP、LHX8及OAS1基因多态性及其与繁殖性状的关联性。通过不同样品的混池,利用Sanger直接测序法查找NR5A2基因外显子的SNP位点,通过HRM分型技术分析SNP位点的多态性;利用Sanger直接测序法测序查找OOEP、LHX8及OAS1基因外显子的SNP位点;使用SPSS19.0软件分析NR5A2、OOEP、LHX8及OAS1基因基因SNP与母猪总产仔数、产活仔数、仔猪初生重、3周龄重、断奶重及断奶仔猪数、乳头数的关联性。研究结果显示:1.松辽黑猪NR5A2基因第6外显子上存在1个SNP位点,命名为C99T,检测到3种基因型,分别是CC、CT和TT。群体遗传参数分析及卡方适合性检验结果显示,该SNP位点在松辽黑猪群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）,但C/T突变位点杂合度相对较低,在松辽黑猪群体中的变异较小,属于中度多态（0.25<PIC<0.5）。关联分析结果表明,在NR5A2基因C99T位点上,CC基因型的总产仔数、产活仔数及断奶仔猪数均最高,其中总产仔数CC基因型显著高于TT基因型（P<0.05）,产活仔数及断奶数CC基因型均显著高于TT及CT基因型（P<0.05）;各基因型仔猪初生重,3周龄重、断奶重及乳头数无显著差异（P>0.05）。2.松辽黑猪OOEP基因第2外显子100bp和136bp位点处存在SNPs位点,分别命名为C100T和A136C,在C100T位点上检测到3种基因型,分别为CC、CT和TT。在A136C位点上则检测到AA、AC和CC基因型。群体遗传参数分析及卡方适合性检验结果显示,在松辽黑猪群体中2个SNPs位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态（P<0.01）,C/T和A/C突变位点杂合度处于中等水平,属于中度多态（0.25<PIC<0.5）;关联分析结果表明,在OOEP基因第2外显子C/T和A/C突变位点上,不同基因型在总产仔数、产活仔数、仔猪初生重、3周龄重、断奶重及断奶仔猪数、乳头数差异不显著（P>0.05）,其中TT（CC）基因型在总产仔数、产活仔数及断奶数均高于CC（AA）和CT（AC）基因型。3.松辽黑猪LHX8基因外显子2～9均未检测到SNP位点。4.松辽黑猪OAS1基因外显子2、外显子3和外显子6上共检测到33个突变位点;0AS1基因第2外显子110 bp处存在1个SNP位点,命名为G110C,在G110C位点上检测到3种基因型GG、GC和CC,其中GC基因型总产仔数、产活仔数和断奶仔猪数显著高于GG基因型（P<0.05）;0AS1基因第3外显子176 bp处存在1个SNP位点,命名为C176T,在C176T位点上检测到3种基因型CC、CT和TT,其中CT基因型断奶仔猪数显著高于CC基因型（P<0.05）;OAS1基因第6外显子145 bp处存在1个SNP位点,命名为C145T,在C145T位点上检测到3种基因型CC、CA和AA,其中CC基因型在总产仔数和产活仔数显著高于AA基因型（P<0.05）;在166 bp处存在1个SNP位点,命名为G166A,在G166A位点上检测到3种基因型GG、GA和AA,其中GA基因型断奶仔猪数显著高于GG基因型（P<0.05）;在206 bp处存在1个SNP位点,命名为A206G,在A206G位点上检测到3种基因型AA、AG和GG,其中GG基因型总产仔数和产活仔数显著高于AA基因型（P<0.05）。群体遗传参数分析及卡方适合性检验结果显示,松辽黑猪OAS1基因第2外显子G110C突变位点符合Hardy-Weinberg平衡状态,第3外显子C176T和第6外显子C145A、G166A和G206A突变位点均偏离Hardy-Weinberg平衡状态;各SNPs位点遗传杂合度均位于中等水平;处于中度多态（0.25<PIC<0.5）。
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