猪精子获能前后转录组及miRNA差异表达研究

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精子获能是哺乳动物精子成熟的重要过程之一。精子必须在雌性生殖道或者体外培养一定时间后才能够识别并结合到卵母细胞透明带,最后与卵母细胞融合形成受精卵。研究表明,体内外诸多因素如肝素、血清白蛋白、钙离子及重碳酸盐均可导致精子质膜胆固醇流失、Ca2+和cAMP含量增加以及蛋白质酪氨酸磷酸化等获能相关的生理生化变化。此外,研究也发现,miRNA及mRNA也参与精子获能。但是,有关精子获能及其调控的分子机制尚不清楚。因此,本试验以猪新鲜和获能精子为研究对象,采用转录组、小RNA测序方法比较新鲜精子与获能精子中miRNA和mRNA的表达差异,通过GO和KEGG分析差异表达miRNA与mRNA基因在获能精子中的功能,为进一步研究精子体外、体内受精等过程奠定了科学的理论基础。研究结果如下:(1)利用Illumina HiSeq 2500平台对猪新鲜与获能精子进行了转录组测序分析,分别得到26,843,452和29,925,873条Clean data,Q30大于86%。最终获得5,342个差异表达mRNAs,其中表达量显著上调和显著下调的mRNA s分别有503个和4,839个。对差异表达的mRNAs进行GO和KEGG分析,这些差异表达的mRNAs主要富集到Wnt、MAPK、PI3K-Akt信号通路、能量代谢以及精子获能相关通路。(2)利用Illumina HiSeq 2500平台对猪新鲜与获能精子进行小RNA测序分析,分别得到12,561,033和11,222,990条Clean data,Q30大于86%。最终获得204个差异表达的miRNAs,其中表达量显著上调和显著下调的miRNAs分别有86个和118个,这些差异表达的miRNAs中有66个是已知的,152个是新发现的,并且在新鲜精子和获能精子中特异性表达的miRNAs分别有16个和9个。对差异表达的miRNAs进行靶基因预测,以及对miRNAs靶基因进行GO和KEGG功能分析,表明这些差异表达的miRNA靶基因主要富集到细胞、代谢过程等信号通路。(3)15个miRNAs(miR-34c、miR-1、miR-214、miR-374b、miR-1343、miR-127、miR-151-3p、miR-1285、miR-133a-3p、miR-101、miR-378、conservation_3_15893、conservation_7_221178、unconservation_7_234335、unconservation_11_42222)及其对应的20个差异表达的靶mRNA(ADPGK、PFKP、PGK2、PHKG2、CD36、PSPI、PDE4A、AKAP3、VDAC1、Cat Sper4、CABYB、ACRBP、COL11A1、HSPA2、CYP19A1、MYC、PRDX5、DNM1、ABCA1、CLU)涉及PI3K-Akt、MAPK、cAMP-PKA及Calcium信号通路等获能相关的通路,它们参与精子获能过程。
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