本研究目的在于分析空间环境引起水稻当代材料基因组突变的序列特点及突变的可遗传性。通过对神舟6号飞船搭载的粳稻品种珍珠红、莲粳2号及越光的当代材料，应用AFLP技术进行基因组水平变化分析，应用16对引物在三个品系中分别检测到1061、933、1054个位点。其中，三个品种的无明显表型变化植株(记作SP)的基因组突变率分别为3.4％-10.1%、3.3%-8.5%及4.0%-10.1%；珍珠红两个表型变异株(记作MSP)突变率分别为13.7%和12.1%，莲粳2号表型变异株的突变率为13.1%；三个品系地面对照单株之间的多态性为0-0.5%。可见，地面对照之间多态性远低于空间飞行引起的基因组突变率，且表型突变株基因组突变率大于非表型突变株。对19个差异条带的分析表明，其中9个片段在GenBank中无匹配序列，10个有匹配序列。匹配的序列位点在诱变和对照中的序列比对结果表明，空间环境引起水稻基因组突变既涉及单碱基突变，又涉及染色体大片段变化。10个匹配序列中有3个与转座子相关，推测转座相关机制可能参与空间环境诱导水稻突变。为了研究突变位点的遗传性，对其中两个突变位点(一个位于转座子区，一个位于非基因区)在突变株MSP-4的二代(10株)和相应的三代后代(30株)中验证，分别在二代和三代中发现突变位点的比率为6/10、10/18(Z-15)和7/10、6/21(Z-9)，表明该突变可以遗传给后代，但某些二代中没有突变位点的在三代中反而出现了突变，推测空间诱变使得基因组中的某些位置变得不稳定。本研究的结果为探讨空间环境诱变的机理提供了新的线索。