我国目前的土地市场仍然处于城乡二元分割的状态。2013年十八届三中全会《关于全面深化改革若干重大问题的决定》中明确提出:“在符合规划和用途管制前提下,允许农村集体经营性建设用地出让、租赁、入股,实行与国有土地同等入市、同权同价”。农村集体经营性建设用地入市这在破除城乡二元体制、推动城乡一体化发展、促进农村土地资源的优化配置和增加农民权益保障等方面有重大的积极作用。其中,流转收益分配是农村集体建设用地入市的核心,合理的收益分配能够保证农村集体经营性建设用地顺利入市,也可以保证国家、集体和农民的基本利益。本文以农村集体经营性建设用地流转收益的分配为研究对象,基于马克思地租理论、马克思收益分配理论等理论基础结合国内十个典型试点案例进行比较分析,探讨农村集体经营性建设用地流转收益的成因及分配。经研究后发现,以提高农民的分配比例为目的,在兼顾国家、集体、农民三方利益的前提下,合理分配流转收益是农村农村集体经营性建设用地入市的关键。最后,结合我国土地流转收益分配中存在的问题,结合具体实践中的经验,提出了农村集体经营性建设用地入市流转收益合理分配的对策与建议。