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鸡传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitis virus, IBV)侵害鸡群,给养禽业造成了重大的经济损失。不同国家、地区流行的IBV存在差异,因此及时掌握本地区现场流行毒株基因的变异乃至抗原性的变化,对该病的防控和疫苗的研发都非常重要。为进一步了解近年广西IBV流行株的遗传变异情况和为新疫苗的研发提供依据,本课题对2012～2013年的广西IBV分离株进行了如下基因序列分析和血清学鉴定。首先,通过RT-PCR的方法对2012～2013年从广西从免疫失败的鸡群中分离鉴定的15株IBV分离株基因组3’端的S-N基因区段(包含S1、S2、3a、3b、E、M、5a、5b和N基因)进行扩增、测序,应用生物学软件进行相似性分析、进化树分析和重组分析,用在线软件进行O-糖基化位点和正向选择位点分析。序列测定结果显示各分离株的S-N基因区段片段长度为6767 bp～6939 bp。与常用的疫苗株H120以及国内外参考株比较,大部分毒株的S1基因广泛存在氨基酸的缺失、替代以及插入现象,其它各基因片段只存在氨基酸的替代。氨基酸进化树表明,各基因在进化树上不完全平行。重组分析结果显示GX-NN130048的S1基因具有重组现象,来源于LX4型野毒株与疫苗株4/91的重组。O-糖基化位点结果显示15株IBV分离株的N蛋白都有糖基化位点且位点数量最多为21～28个。正向压力检测结果表明,S1蛋白的aa308位置存在正向选择位点。以上结果表明15株IBV分离株九个基因已不同程度的发生变异。其次,测定2012～2013年15株IBV分离株的TOC-ID50,利用本课题组已鉴定出7种不同血清型的单因子血清与15株IBV分离株气管环上进行中和试验。结果显示15株IBV分离株可分为7不同的血清型。GX-NN 130048、GX-YL 13080630、GX-YL 130806200和GX-NN130059属于血清1型;GX-NN120091和X-QZ131126属于血清2型;GX-YL130025属于血清3型；GX-NN 120079禹于血清4型；GX-NN 120084、GX-NN 120089和GX-QZ130065属于血清5型；GX-NN 130003、GX-QZ 130064和GX-NN 130067属于血清6型；GX-NN 130021属于血清7型。重组毒株GX-NN 130048的血清型不同于疫苗株H120和4/91。结果表明了近年广西仍然存在多种血清型。此外,本研究对2012～2013年的15个IBV分离株的血清型和基于四种基因(S1、E、M、N)分型的相关性进行分析。结果发现,基于S1基因序列的基因分析和血清分型之间符合率为66.7%(10/15),而基于其它基因的符合率均为46.7%(7/15)。由此可知,基于S1基因序列的基因分型比基于E、M和N基因序列所做的基因分型与血清分型之间的符合率要高些。本研究表明,近年广西地区IBV不管是在基因型还是血清型上都发生了明显的变异,且出现了疫苗株和优势流行株的重组现象,这可能导致免疫失败的主要原因。本研究为更全面阐述IBV变异规律和分子机制以及为新疫苗的研发提供依据。