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THz波作为电磁波频谱中的空白波段，具有巨大的发展潜力，将被广泛应用于未来高速率、超宽带无线通信系统领域。THz波滤波器是THz通信系统中关键器件之一，而THz技术和光子晶体技术的结合为THz波滤波器的设计提供了扎实的理论基础，随着密集波分复用通信系统的快速发展，对THz波多波长滤波器的研究具有重要意义。本文设计了一种基于复式正方晶格THz双波长滤波器，首先分析了光子晶体滤波器的原理；利用在完整光子晶体上引入点、线缺陷，并在点缺陷处填充砷化镓（GaAs），设计了具有双波长选频滤波功能THz滤波器；然后采用FDTD方法对该滤波器点缺陷处缺陷模、滤波器主波导和滤波波导的透射谱进行数值仿真，确定THz双波长选频滤波器的最优结构参数，并对该滤波器的各项性能指标进行了分析；仿真结果表明，采用复式晶格结构的光子晶体带隙范围大，可通过一个点缺陷出现两个缺陷模，所设计的THz双波长滤波器可实现62.511μm(4.799THz)和65.925μm (4.551THz)的超窄带双波长选频滤波功能，该滤波器滤波效率高达97.62%、信道隔离度为22.57dB、插入损耗0.08dB、滤波器整体响应时间为64ps，性能优良。在THz双波长滤波器的基础上，在点缺陷处引入三阶非线性材料掺杂香豆酮的聚苯乙烯，通过控制作用于点缺陷处的泵浦光强，设计出可调谐的THz双波长选频滤波器，分析滤波器的动态可调谐滤范围；仿真结果表明，该滤波器可实现中心频率可调的双波长滤波功能，动态可调谐范围为41.534~41.834μm和74.264~75.164μm，最大动态迁移量为0.9μm，滤出的波长尖细陡直，频带宽度小，为制作性能优良的可调谐窄带双波长滤波器奠定基础。最后，探讨了THz双波长滤波器在未来THz通信系统中的应用。