作为我国重要的基础产业,农业发展一直受到高度关注。在一系列国家政策的引导下,越来越多的电商企业开始进军农业。目前,农业电商企业采用“公司+农户”和“公司租赁”两种农业产业运作模式。这两种农业运作模式各有利弊,因此,农业电商企业在考虑农户交付水平的情况下,如何选择适合其发展的农业产业化运作模式显得尤为关键。研究发现,“公司+农户”模式能够有效节省农业电商的运营管理成本,降低由于订单违约所造成的损失,但也使电商企业面临着潜在的金融风险。而“公司租赁”模式虽然能够避免农户融资风险,但电商企业需要承担订单违约的全部风险。为了更好的比较两种模式,本文研究由农业电商企业和受资金约束的农户所构成的农业供应链,在考虑农产品交付水平的前提下,分别构建了两种运作模式下的决策模型,得到了农业电商企业和农户在不同模式下的最优策略,通过对比分析找到了能够实现供应链最优运作的“双赢”区间。最后,利用京东“跑步鸡”的市场数据进行数值实验,验证了相关的研究结论。研究表明:(1)当农户抵押物的价值较高或较低时,农户将选择“公司租赁”模式;(2)对整个农业供应链来说,“公司租赁”要优于“公司+农户”;(3)存在关于土地租金的“双赢”区间,使得农业电商企业和农户在该区间内都将选择“公司租赁”模式。