HRI激酶中血红素轴向配体的DFT研究

来源 :中山大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nvli2010
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
真核翻译起始因子激酶eIF2α是细胞遇到紧急状态期间调整蛋白质合成的一种重要激酶。四种eIF2α激酶之一的HRI激酶广泛存在于生命体各组织中。当heme的铁缺乏时,HRI激酶发生反应,从而调节球蛋白的合成。Heme的轴向配体是触发HRI激酶功能的关键。因此确定HRI激酶中heme的轴向配体以及结合位置对HRI激酶的活化机理和调控机制的研究具有重要意义。   早期实验研究中,Kyoko Hirai等人对离体野生型和Cys残基突变的KI区域蛋白质进行可见吸收光谱、共振拉曼光谱和EPR谱的检测。基于对光谱数据的分析,实验得到的结论是:至少是在孤立的KI区域上,HRI激酶中与铁结合的Cys385是heme的轴向配体。然而,实验无法确定HRI激酶中是否存在其他氨基酸残基结合为heme的轴向配体的可能。   本文运用Gaussian03量子化学程序包,用密度泛函(DFT)方法在B3LYP/6-31G*的基组水平上对HRI激酶中可能存在的9种heme的配合物进行结构的优化,在优化好的基础上进行吸收光谱和拉曼光谱的计算。通过计算所得吸收光谱、拉曼光谱与文献实验光谱的特征值进行对比,初步确定了HRI激酶中血红素的轴向配体及其相应的heme配合物的结构。计算光谱的结果支持了五配位低自旋的Fe(Ⅱ)heme-Cys、Fe(Ⅱ)heme-His、Fe(Ⅱ)heme-NO配合物以及六配位低自旋的His-Fe(Ⅱ)heme-CO、Cys-Fe(Ⅱ)-His和His-Fe(Ⅱ)-NO配合物的存在。同时,在计算结果的基础上,分析了HRI激酶中heme配合物的几何结构特点。作出部分前沿分子轨道图,对HRI激酶中heme的配合物的特征吸收光谱进行了理论解释,确认了特征吸收光谱的电子跃迁方式。基于文献对HRI激酶的激活机理的猜测,试图通过对结构的解析,判断出对HRI激酶的激活最有效的残基。从而最终能对HRI抑制蛋白质合成的保护机制的进一步研究带来理论指导作用。
其他文献
江泽民同志关于党的基本纲领和最高纲领的辩证统一关系的论述 ,是对马克思、恩格斯、列宁关于党的纲领学说的继承和发展 ,是对中国共产党 80年历史经验的科学总结。坚持党的
阳离子荧光化学传感器,作为一种有望替代传统的重金属离子检测手段,因其成本低廉,检测快速,操作简单等优点而备受关注。以香豆素为母体制备出的一系列阳离子荧光化学传感器,
自适应控制工程可以根据内外扰动、时变形、具有很大不确定性的对象的变化,控制调整期参数,使得系统运行达到最优的状态。在国内外应用研究当中,综述了自适应控制的应用研究
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
为了从海洋及海洋边缘生物中寻找新的生物活性成分,对采自中国海南的红树林植物露兜树pandanus tectories和海洋真菌ZT6-11次生代谢产物进行了系统的化学成分研究。采用常规的硅胶柱层析(CC),制备薄层层析(PTLC),凝胶色谱柱层析及重结晶等分离手段,从露兜树和海洋真菌次生代谢产物中共分离得到了21个单体化合物。利用各种现代波谱技术(1H NMR、13C NMR、DEPT、1H-1H
期刊
微博的原创性强、交互程度高,很好地满足了大学生对于高素质生活的要求,微博在大学生中的受欢迎程度相比其他人群更高。利用微博在大学生中进行思想政治教育,提出了扩展高校
本论文主要包括:(1)铜(Ⅰ)和银(Ⅰ)的炔基配合物的合成并研究其结构与光物理性质的研究;(2)含脲和硫脲基团的阴离子受体的合成与表征,并研究其与阴离子的识别作用。本论文共分四
抗肿瘤芳基钌配合物具有靶向性、毒性低及优良的抗癌活性等优点,而备受关注。具有生物活性芳基钌药物的能够抑制DNA的复制和DNA多态性的扩增,导致肿瘤细胞的死亡。但除此之外,确定潜在的钌(II)芳烃配合物的抗癌药物在治疗过程中,其吸收、分布、生物体内的代谢和排泄特性还是未知数。芳基钌(II)-TSC配合物抗肿瘤药物与生物大分子的相互作用机制研究有助于我们更好的理解其抗菌、抗肿瘤的作用机理,针对性设计合
化学修饰电极在食品、环境、生物和药物分析中扮演一个重要的角色。本文旨在研究化学修饰电极在电化学分析领域的进一步应用,即制备化学修饰电极监测纳米载药体系的体外溶出