Graves病患者外周血环状RNA表达谱分析及对Tfh细胞的影响

来源 :江苏大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gs086449
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:采用二代高通量测序技术(Next-generation sequencing,NGS),对Graves病(Gravesdisease,GD)患者和健康对照者(healthycontrol,HC)外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)中环状RNA(circular RNA,circ RNA)进行测序并分析其表达谱;扩大样本量验证显著差异表达的circ RNAs,分析其与甲状腺自身抗体水平的关系及对GD的诊断作用;运用生物信息学技术分析差异表达的circ RNAs可能在GD中发挥的作用;进一步分析hsa_circ_0114427在GD发病中的作用,探索circ RNAs在GD发病中的调控机制及作为GD诊断的生物标志物的可能性。方法:1.收集5例GD患者和5例HC外周血标本,采用Ficoll法分离PBMCs并提取RNA,运用NGS对提取的RNA构建测序文库,获得circ RNAs的表达谱。2.在circ RNAs表达谱中筛选出显著差异表达差异倍数(FC)≥2.0、P≤0.05的六个circ RNAs,选取40例GD及40例HC的外周血标本,通过实时荧光定量PCR(real-time quantitative polymerase chain reaction,RT-q PCR)技术进一步验证差异表达的circ RNAs,分析差异表达的circ RNAs与甲状腺自身抗体TRAb、TGAb、TPOAb的相关性,运用ROC曲线分析差异表达的circ RNAs对GD的诊断价值。3.通过基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopediaof Genesand Genomes(KEGG)Pathways)对GD中差异表达的circ RNAs进行功能分析,推断其可能参与的信号通路及发挥的作用。4.生物信息学分析circ RNAs可能吸附的mi RNAs,结合Target Scan数据库和mi RDB数据库筛选可能调控的靶基因。5.采用RT-q PCR技术验证GD患者PBMCs中mi R-29a-3p、ICOS、IL-21的表达水平。6.通过流式细胞术(Flow cytometry,FCM)分别检测GD组与HC组PBMCs中Tfh(CD3+CD4+CXCR5+ICOS+)细胞比例。7.分析hsa_circ_0114427与mi R-29a-3p、ICOS、Tfh细胞及IL-21的相关性,转染hsa_circ_0114427 inhibitor至正常人PBMCs,RT-q PCR检测hsa_circ_0114427、mi R-29a-3p、ICOS、IL-21 m RNA的表达水平,荧光抗体染色后FCM检测ICOS表达变化及Tfh细胞比例变化。8.分析mi R-29a-3p与ICOS、Tfh细胞及IL-21的相关性,转染mi R-29a-3p mimic至正常人PBMCs,RT-q PCR检测mi R-29a-3p、ICOS、IL-21 m RNA的表达水平,荧光抗体染色后FCM检测ICOS表达变化及Tfh细胞比例变化。结果:1.二代高通量测序结果显示,与HC组相比,GD组中共检测出36910个circ RNAs,包括23215个上调circ RNAs和13695个下调circ RNAs,其中,360个上调circ RNAs和309个下调circ RNAs差异具有显著性(差异倍数≥2,P≤0.05)。2.RT-q PCR验证结果显示,上调的hsa_circ_0114427、hsa_circ_0007470、hsa_circ_00048232和下调的hsa_circ_0002672验证结果与高通量测序结果保持一致,下调的hsa_circ_0002600、hsa_circ_0039161表达无统计学意义。hsa_circ_0114427与GD自身免疫性抗体TRAb、TGAb、TPOAb呈正相关性,ROC曲线下面积,hsa_circ_0114427(AUC:0.7756,95%CI 0.6695 to 0.8817,P<0.0001)。3.GO分析显示,GD中表达上调的circ RNAs富集的生物学途径有415条目,细胞组分有81条目,分子功能有132条目;表达下调的circ RNAs涉及的生物学途径有243条目,细胞组分58条目,分子功能96条目。KEGG作用通路分析显示,差异表达上调的circ RNAs参与到的信号通路有20条,表达下调的circ RNAs参与到的信号通路有15条。4.GD患者PBMCs中mi R-29a-3p表达下调,ICOS、IL-21表达上调(P值均<0.01)。5.FCM检测发现GD患者Tfh细胞比例较HC组增多[(6.33±3.29)%vs(2.88±1.08)%,P<0.05]。6.hsa_circ_0114427与mi R-29a-3p呈负相关(r=0.3285,p=0.0412),hsa_circ_0114427与ICOS、Tfh细胞比例、IL-21呈正相关(r=0.4268,p=0.0060)(r=0.4375,p=0.0048)(r=0.7292,p<0.0001)。转染hsa_circ_0114427 inhibitor后mi R-29a-3p m RNA增多,ICOS、IL-21m RNA下降,FCM检测Tfh细胞比例、ICOS细胞比例下降。7.mi R-29a-3p与ICOS、Tfh细胞比例、IL-21呈负相关性(r=-0.3253,p=0.0433)(r=-0.3414,p=0.0334)(r=-0.3258,p=0.0459)。转染mi R-29a-3p mimic后ICOS、IL-21 m RNA下降,FCM检测Tfh细胞比例、ICOS细胞比例下降。结论:1.GD患者PBMCs中存在差异表达的circ RNAs,hsa_circ_0114427有显著差异,且与GD自身抗体TRAb、TGAb、TPOAb具有相关性,ROC曲线提示hsa_circ_0114427有作为GD诊断分子标志物的可能性。2.GO分析及KEGG分析结果提示差异表达的circ RNAs具有不同的生物学过程、细胞组分及分子功能,参与“PI3K-Akt”、“MHCⅡ/TCR”、“CD40/CD40L”等信号通路。3.GD患者体内Tfh细胞较健康对照组比例增多[(6.33±3.29)%vs(2.88±1.08)%,P<0.05]。4.hsa_circ_0114427在GD中潜在调控机制可能是通过靶向mi R-29a-3p调控ICOS的表达,并在转录水平和翻译水平调控Tfh细胞的变化。
其他文献
目的:分析兰州市城关区不同年龄、性别学龄前儿童全血中铜、锌、钙、镁、铁五种常见微量元素含量、维生素D3水平、儿童的营养现状和生长发育状况,并探讨钙元素与维生素D3、微量元素与儿童生长发育的相关性,为指导本地区学龄前儿童科学合理膳食提供参考。方法:选取2019年5月-7月兰州市城关区妇幼保健院所辖10所幼儿园1393名3~7岁学龄前儿童为研究对象,体格检查获得其身高、体重等基本数据,实验室生化检测其
学位
目的由于呼吸道传染病对人群健康造成了严重的危害,为了避免其影响进一步扩大、损害生命质量,则需预防呼吸道传染病疫情的暴发。因此,本研究在CEEMD方法的基础上结合参数优化、权重搜索和误差修正方法建立误差修正预测模型,并利用2004-2017年中国法定报告的肺结核、猩红热和百日咳月发病率的时间序列数据对其准确性和可靠性进行验证,旨在为具有不同流行特征的呼吸道传染病提供一种可行的预测方法,进而为相关部门
学位
自从2004年石墨烯独特性质得到确认以来,类石墨烯二维层状材料的制备及性质研究得到了快速发展。通常,二维层状材料可以剥离得到组成单元纳米片层,这些纳米片层显示出可调控的光学、电子、催化和电化学性质,是发展高性能光电器件的重要单元,显示了广阔的应用前景。单元素二维层状材料如黑磷、硼烯等是二维层状材料中的特殊一类,单元素纳米片层制备及其光电性质研究,将为二维材料表面科学基础研究和开发新型光电材料提供新
学位
研究目的本研究通过调查腹腔镜胆囊切除术患者术后恢复现状,结合多学科合作管理模式对腹腔镜胆囊切除术患者进行护理干预,分析多学科合作管理模式对腹腔镜胆囊切除术患者术后恢复的影响,以期为腹腔镜胆囊切除术患者的术后康复干预方案制定提供依据。研究方法本研究包括两部分,第一部分为腹腔镜胆囊切除术患者术后恢复现状,选取于2019年1月~2019年12月期间南京市3家三甲医院内接受腹腔镜胆囊切除术治疗的518例患
学位
茵陈蒿汤为《伤寒论》中的经典方剂,由茵陈、栀子和大黄三味药组成。主治症候湿热黄疸,同时具有利胆退黄、抗肝损伤等作用,临床上已广泛用于治疗肝胆系统疾病、高脂血症等。茵陈蒿汤因其不可替代的临床药效至今仍被广泛使用。其传统用药剂型为汤剂,但汤剂在制备、携带、服用等方面的不便利性限制了临床的推广和使用。因此亟需探索具有重要现代临床应用价值的茵陈蒿汤新剂型。本研究期望通过现代工艺提取药材中有效成分,并与适宜
学位
覆盆子(Rubus chingii Hu)是药食同源植物,其未成熟浆果是具有益肾固精和抗衰老等功效的收涩类中药,而其成熟浆果可鲜食,亦可加工为果酱和果酒等。已有研究表明,覆盆子富含多酚类化合物,具有显著的抗氧化、抗炎及抗肿瘤等活性,在食品、药品、保健品和化妆品有着广泛的应用。但目前覆盆子多酚的高效绿色提取方法有限,其口胃肠的稳定性也缺乏了解。因此,本文优化了覆盆子多酚超声辅助低共熔溶剂(Deep
学位
日益加重的能源问题以及人们对生活质量日渐增长的需求,使得新能源产业应运而生,且逐渐成为与人类社会发展息息相关的一部分。近年来,许多领域的研究人员都对新能源行业高度重视,直接促使了该行业的迅猛发展。而多相内嵌式永磁同步电机(Multi-phase Interior Permanent Magnet Synchronous Motor,IPMSM)除了具备三相IPMSM转矩密度大、功率因数高以及调速区
学位
柴胡蒌菇汤具有疏肝理气,化痰散结的功效,用于治疗乳腺癌、肝郁气滞痰凝的复方汤剂,收载于《中医肿瘤学》。经过长期的临床应用,已证明该处方安全、有效。该方剂由柴胡、青皮、橘叶、郁金、当归、白芍、茯苓、白术、山慈菇、全瓜蒌、白芷11味中药组成。汤剂在制备和使用过程中有诸多不便。本研究以中医药理论为指导,采用中药材提取分离技术,高效的固体制剂技术,将柴胡蒌菇汤剂进行二次开发,研制柴胡蒌菇固体颗粒剂,对提取
学位
碳酰氟(CF2O)作为大气中重要含氟化合物,其广泛来源于大气中含氟烃类化合物及含氟烃类化合物衍生物的降解。因其分子在大气环境下具有较高的光稳定性与热稳定性,使得CF2O在大气环境中难以降解,其含量逐年增加,约占大气环境中无机氟化物的三分之一。近年,CF2O的水解反应被认为是大气中CF2O清除的重要途径之一。基于已有实验观测和初步的理论研究,本文采用量子化学计算和从头算分子动力学模拟深入研究了 CF
学位
新基因或基因新功能的产生是生物性状创新的基础,在生物对复杂环境的适应性演化中扮演重要角色。单个基因重复、染色体片段重复和全基因组复制都可以带来新基因的产生,是基因家族形成和扩张的根本原因。CBF类基因隶属于植物特有的AP2/ERF转录因子家族中DREB亚家族,其编码的转录因子能够特异识别并结合在下游响应基因启动子的CRT/DRE元件上、激活基因的表达,从而增强植物对环境冷胁迫(CBF1/2/3)或
学位