目的卵巢癌是常见的女性生殖器官恶性肿瘤之一,对女性生命健康造成严重威胁,但是目前还未建立较为灵敏有效的卵巢癌早期诊断方法。DNA的异常甲基化在卵巢癌的发生发展中扮演了重要角色,故而其可能成为卵巢癌的早期诊断指标。然而目前大多数的甲基化研究的样本来源于组织,采取组织对于癌症的早期诊断存在一定的局限性。外周血液DNA甲基化的检测具有采样方便、简便易行和适合大样本研究等优势,而目前外周血液白细胞DNA的甲基化水平是否能用于卵巢癌的早期诊断尚不清楚。本研究采用全表观基因组关联研究策略,通过两阶段的病例对照实验设计,分析甲基化水平与卵巢癌发病的关联,并按FIGO分期进行分层分析,最终阐明用于卵巢癌早期诊断的外周血白细胞DNA甲基化指标,为卵巢癌的早期诊断和高危人群的筛选提供依据,也为处于研究初期的表观遗传流行病学和全表观基因组关联研究提供新的经验和基础。方法本研究采用全基因组关联研究策略,运用病例对照的研究方法对全基因组甲基化位点进行检测,比较病例和对照的甲基化水平差异。本研究包括全基因组检测(I)和验证研究(II)两个阶段。在全基因组检测阶段,共选取24例卵巢癌病例和24例对照按照发病年龄进行1:1的匹配,用Illumina 450K Infinium Methylation芯片检测450,000多个甲基化位点在病例和对照中的甲基化水平,筛选出96个差异甲基化位点。在验证阶段,另外选取232例卵巢癌病例和232例对照按照发病年龄进行1:1的匹配,采用Illumina Custom Vera Code Methylation芯片对上述的96个甲基化位点进行验证,并根据FIGO分期进行分层分析,所得P值按照FDR法校正,筛选出与卵巢癌发病相关的差异甲基化位点,并通过绘制ROC曲线,阐明外周血白细胞DNA甲基化对于卵巢癌发病风险的诊断价值。采用David Bioinformatics Resources对差异甲基化位点附近的基因进行通路富集分析,为进一步揭示甲基化异常改变与卵巢癌发病的机制提供初步线索。结果通过全基因组检测和验证研究,本研究共筛选出40个与卵巢癌发病风险相关的差异甲基化位点(FDR<0.05)。在FIGO分期为I和II期的病例中,共筛选出23个差异甲基化位点(FDR<0.05);在FIGO分期为III和IV期的病例中,共筛选出39个差异甲基化位点(FDR<0.05)。将验证阶段所得的40个差异甲基化位点建立ROC曲线,所得ROC曲线下面积(AUC)为0.827(0.789-0.865);对于FIGO分期为I、II期的病例,23个差异甲基化位点联合所得AUC为0.765(0.720-0.809);对于FIGO分期为III、IV期的病例,39个差异甲基化位点联合所得AUC为0.818(0.778-0.857)。对所筛选出的40个差异甲基化位点附近的55个基因进行通路富集分析,分析结果包括白细胞介导的细胞毒性作用、细胞杀伤功能、异源三聚体G蛋白复合物通路等。其中白细胞介导的细胞毒性作用的富集倍数最高,三个差异甲基化位点附近的基因NFATC1(cg06784563)、CADM1(cg21933078)和LYST(cg16962115)与该通路相关。结论外周血白细胞DNA甲基化的异常改变对于卵巢癌发病的诊断具有较高的价值,可为卵巢癌的早期诊断和高危人群的筛选提供依据。