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近年来,沿江多个省份都在进行增殖放流活动,特别是2010年湖北省进行大规模四大家鱼亲鱼增殖放流活动以后,亲鱼放流的效果如何,是否会改变长江自然群体的遗传多样性等,成为人们十分关注的问题。因此,为了全方位、多方面更准确的评估鲢亲鱼放流效果以及遗传多样性状况,本文利用两种分子标记系统(微卫星标记和线粒体基因组DNA分子标记),对2010年和2011年在湖北石首江段和湖北监利江段放流的亲鱼以及当年在该江段采集的卵苗经孵化培养后的个体进行亲子鉴定和遗传多样性分析。主要研究结果如下：1、微卫星多重PCR体系的建立及亲子鉴定建立3个多重PCR体系,确定最终各试剂的浓度,25μL体系中分别为：2U Tag DNA聚合酶,0.4mmol/L dNTPs,2.3mmol/L Mg2-,3μL10×PCR Buffer。2、鲢亲本增殖放流效果评估(1)2010年放流亲本鲢479尾,采集野生卵苗并孵化751尾,9个微卫星标记,累积排除率99.79%,置信水平显著且所有位点与父本匹配子代2尾,显著且所有位点与母本匹配子代8尾：2010年放流对长江监利江段鲢苗发生量贡献率为1.33%。(2)2011年放流亲本鲢1144尾,采集野生卵苗并孵化546尾,14个微卫星标记,累积排除率99.91%,置信水平显著且所有位点与父本匹配子代21尾,显著且所有位点与母本匹配子代16尾。2011年放流对长江监利江段鲢苗发生量贡献率为6.78%。3、鲢亲本放流对野生群体遗传多样性的影响(1)利用微卫星标记评估2010年和2011年鲢遗传多样性,结果表明群体具有高的遗传多样性,且建立起来的组合符合亲子鉴定标准。(2)利用线粒体标记评估2010年湘江原种场样本29尾,单倍体数17个,单倍体多样性0.9557±0.0189,核苷酸多样性0.202416±0.100982。(3)利用线粒体标记评估2010年石首放流亲本22尾,单倍体数14个,单倍体多样性0.9481±0.0287,核苷酸多样性0.058185±0.030804；采集监利放流亲本23尾,单倍体数7个,单倍体多样性0.9170±0.0344,核苷酸多样性0.087984±0.045471；采集监利江段采集子代41尾,单倍体数7个,单倍体多样性0.8707±0.0383,核苷酸多样性0.041036±0.021789。(4)利用线粒体标记评估2011年石首放流亲本27尾,单倍体数12个,单倍体多样性0.8832±0.0398,核苷酸多样性0.084086±0.043236；采集监利放流亲本20尾,单倍体数14个,单倍体多样性0.9368±0.0392,核苷酸多样性0.173238±0.088230：采集监利江段采集子代32尾,单倍体数23个,单倍体多样性0.9758±0.0147,核苷酸多样性0.190632±0.094886。(4) AMOVA分析表明变异主要来自种群内,种群间未出现显著分化。凡FST=0.03127也表明遗传变异主要来自种群内。遗传距离分析亦表明群体间遗传距离较小。