三峡工程是治理和开发长江的关键性工程，它改变枢纽上下游河流的水文学和水动力学条件，这些变化和调整必然影响水生生物的栖息环境。浮游植物分布受泥沙、水文的影响，也会受其它条件的限制，如总磷、总氮、pH、水温、透明度等环境因素，不仅对水环境极为敏感，而且是水体初级生物者，其群落结构数量对水体生态系统的演替和发展影响较大。本研究根据三峡库区朝天门到秭归江段2006年11月至2007年11月的监测资料，研究叶绿素a、总磷、总氮、泥沙、水体酸碱度、水温、溶解氧、电导率等因子时空变化规律。对浮游植物密度、生物量与其他水体变量因子作相关性分析，找出了影响浮游植物生长的“主要因子”为：泥沙、溶解氧和温度。用响应曲面法分析“主要因子”间的定量及交互关系。对三峡水库水体指标进行聚类分析，长江干流可区分为二大类：上游区（朝天门、涪陵、石柱、忠县、武阳）和下游区（万州、巫山、奉节、云阳、巴东、秭归）。针对三峡库区河道型水库的特点，初步建立了叶绿素a与各营养物的回归关系模型，用相关加权综合营养状态指数法确定各江段营养级别为贫营养。并与生物评价法的结果比较，阐明相关加权综合营养状态指数法在三峡库区营养状态评价中的优点。