【摘 要】
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目的:探讨宏基因组二代测序（m NGS）对马尔尼菲篮状菌病（TSM）的诊断价值。方法:回顾性分析2018年1月至2020年6月在广西医科大学第一附属医院、南宁市第四人民医院等多中心同时行传统病原学及m NGS检测,其中任一方法提示马尔尼菲篮状菌（TM）阳性32例患者的临床资料。结果:（1）本研究纳入32例TSM患者,男24例,女8例。平均年龄53岁（1-74岁）。误诊肺结核6例,误诊肺癌2例。自然
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目的:探讨宏基因组二代测序（m NGS）对马尔尼菲篮状菌病（TSM）的诊断价值。方法:回顾性分析2018年1月至2020年6月在广西医科大学第一附属医院、南宁市第四人民医院等多中心同时行传统病原学及m NGS检测,其中任一方法提示马尔尼菲篮状菌（TM）阳性32例患者的临床资料。结果:（1）本研究纳入32例TSM患者,男24例,女8例。平均年龄53岁（1-74岁）。误诊肺结核6例,误诊肺癌2例。自然疫源史6例。基础病:人免疫缺陷病毒（HIV）抗体阳性者4例,原发性免疫缺陷病（STAT1基因突变）1例,抗γ干扰素抗体阳性3例。起病至确诊时间平均152天（9-749天）。（2）32例TSM患者中,传统病原学及m NGS均为阳性17例（A组）,传统病原学阳性及m NGS阴性7例（B组）,m NGS阳性及传统病原学阴性8例（C组）。比较A组传统病原学及m NGS分离TM所需天数提示差异有统计学意义（P＜0.01）,m NGS所需天数明显小于传统病原学。以临床样本分离TM为金标准,计算m NGS、传统病原学检测方法灵敏度分别为78.1%（25/32）、75%（24/32）。m NGS阳性25例患者TM序列数中位数为59（6.5,710.5）（1-44050）,其中A组TM序列数中位数为40（6.5,435.5）（1-17087）,C组TM序列数中位数为76（9.5,2138.5）（5-44050）。2例均送检BALF、外周血标本,1例患者BALF序列数17087,外周血序列数216;另1例BALF序列数44050,外周血序列数3。（3）TM分离率:（1）微生物培养:痰7/25（28%）,BALF 9/20（45%）,肺组织1/4（25%）,淋巴结4/4（100%）,皮肤组织4/4（100%）,骨髓培养4/5（80%）,外周血6/13（46.2%）,脓性分泌物4/5（80%）。（2）病理检查:淋巴结组织1/9（11.1%）。（3）m NGS报告:BALF 18/20（90%）,肺组织1/3（33.3%）,淋巴结组织1/2（50%）,皮肤组织1/1（100%）,外周血6/8（75%）,脓性分泌物1/1（100%）。（4）临床表现:咳嗽（81.3%）,咳痰（78.1%）,发热（71.8%）。实验室检查:白细胞总数、中性粒细胞及淋巴细胞计数均值分别为16.14×10~9/L、13.48×10~9/L、1.54×10~9/L。肝功能异常9例。血肌酐升高9例。胸部C T多见斑片状影、结节影、纵隔/肺门淋巴结肿大。骨ECT多见溶骨破坏。3例PET/CT均提示肺癌。支气管镜多见结节、支气管狭窄。病理多见肉芽肿性炎。（5）29例患者抗真菌治疗,其中21例好转,4例死亡,4例自动出院。结论:1、TSM临床表现、实验室检查、影像学、支气管镜等无明显特异性,传统病原学分离TM时间长,常误诊为肺结核、肺癌等疾病,起病至确诊时间长,早期诊断困难,有效治疗开始时间多处于疾病晚期。2、m NGS在诊断TSM患者时病原学阳性标本分布与传统病原学一致,诊断效率高于传统病原学检测,灵敏度高,适用于TSM早期、快速、有效诊断,同时筛查有无其他特殊病原体感染,有望减少误诊、改善预后。3、TSM患者的m NGS报告中TM序列数可能因疾病进程、送检标本是否为原发感染病灶、测序平台检测技术、送检前是否抗真菌治疗而有所不同,如m NGS报告中TM阳性,结合临床表现符合TSM,无论TM序列数高低均有意义,建议早期应用抗真菌治疗。4、m NGS送检标本应根据原发感染病灶选择,如主要为呼吸系统感染建议优先选择BALF、肺组织,如主要为淋巴结肿大或皮疹,可选择淋巴结、皮肤组织。
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