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以荷斯坦和荷-娟F1牛作为实验动物,采用比色法对不同群体奶牛在热应激和非热应激期血清中的丙二醛（MDA）含量、总超氧化物歧化酶（T-SOD）活力、总抗氧化能力（T-AOC）和一氧化氮合酶活力（NOS）四个指标进行检测分析,并比较了群体间抗氧化能力的差异;采用PCR-SSCP技术对与耐热性状密切相关的热应激基因（HSP）和一氧化氮合酶基因（NOS3）进行了SNP分析,对部分基因型个体的PCR产物进行测序和序列比较,并分析了标记基因型与不同奶牛血清生化指标间的相关。结果表明:（1）热应激期,两个群体奶牛血清MDA含量、T-SOD活力差异显著（P＜0.05）,NOS活力差异极显著（P＜0.01）。非热应激期,四个指标均无显著差异（P＞0.05）。不同温度下,荷-娟F1和荷斯坦牛血清MDA含量、T-SOD活力差异均极显著（P＜0.01）,NOS活力差异显著（P＜0.05）,荷斯坦牛血清中T-AOC差异显著（P＜0.05）,而荷-娟F1 T-AOC差异不显著（P＞0.05）。（2）HSP基因发现两个多态位点（HSPA8-intron7、HSPA3-exon1）,NOS3基因发现五个多态位点（NOS3-exon3、NOS3-exon4、NOS3-exon8、NOS3-exon13和NOS3-exon16）。测序发现HSPA8-intron7座位存在T缺失突变以及C→G转换和T→C颠换突变;HSPA8-exon4座位发现A缺失突变;HSPA3-exon1座位发现C→A颠换突变;NOS3-exon8座位发现G→A颠换突变。（3）NOS3-exon4座位,荷斯坦牛与荷-娟F1牛基因型分布差异显著（P＜0.05）,其它座位基因型分布均无显著差异（P＞0.05）。（4）HSPA3-exon1和NOS3-exon13扩增片段,两个奶牛群体都属中度多态,HSPA8-intron7扩增片段,均为低度多态;NOS3-exon3扩增片段,荷斯坦牛群体为高度多态,而荷-娟F1群体为中度多态;NOS3-exon8和NOS3-exon16扩增片段,荷斯坦牛群体为低度多态,荷-娟F1群体为中度多态。（5）NOS3基因五个位点不同基因型与NOS活力的相关性分析表明:荷斯坦牛,NOS3-exon3座位AC基因型与NOS活力呈正相关,A基因为优势等位基因;NOS3-exon13座位AB基因型与NOS活力呈正相关,B基因为优势等位基因。荷-娟F1牛NOS3-exon3座位AA和AB基因型与NOS活力呈正相关,A基因为优势等位基因;NOS3-exon4座位CC基因型与NOS活力呈正相关,C基因为优势等位基因。NOS3-exon8座位AC基因型与NOS活力呈正相关,C基因为优势等位基因。（6）HSP基因两个位点不同基因型与血清抗氧化指标的相关性分析表明:荷斯坦牛,HSPA3-exon1座位AB和BB基因型与T-SOD活力呈正相关,B等位基因为优势等位基因。荷-娟F1牛HSPA3-exon1座位AA基因型与MDA含量呈正相关,AB和BB基因型与MDA含量呈负相关;AB和BB基因型与T-SOD活力呈正相关,AA基因型与T-SOD活力呈负相关,B等位基因为优势等位基因。HSPA8-intron7座位AB基因型与T-SOD活力呈正相关,B等位基因为优势等位基因。