DNA条形码技术在斜盖伞属及其近缘属物种鉴别中的应用

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DNA条形码(DNA barcoding)技术已被广泛应用于物种分类和鉴定中。斜盖伞属(Clitopilus)真菌具有重要的食用和药用价值,但由于物种形态特征及分子系统发育研究不足,该属下某些物种未能得到很好的认识。本文对斜盖伞属及其近缘属小斜盖伞属(Clitocella)和拟斜盖伞属(Clitopilopsis)开展DNA条形码物种鉴别技术研究。通过筛选出合适的DNA条形码片段,来准确鉴定和鉴别各属下的物种,阐明我国这三属的真菌物种多样性,并解析属种间的亲缘关系。主要结论如下:1.斜盖伞属及其近缘属的DNA条形码研究本研究挑选5个基因片段(核糖体内转录间隔区ITS、核糖体大亚基LSU、基因编码翻译延长因子tef1、基因编码RNA聚合酶II第二大亚基rpb2和ATP合酶6亚基基因atp6)和3个联合基因片段组合(ITS-LSU-rpb2、ITS-tef1-rpb2和LSUtef1-rpb2-atp6)来进行评价。基于引物通用性、序列质量、DNA条形码间隔区和属种鉴定准确性,研究发现ITS,LSU和atp6均不宜作为这三属合适的DNA条形码候选片段。在单片段分析中,种内变异上,rpb2>ITS>tef1>atp6>LSU,而种间变异上,tef1>rpb2>ITS>atp6>LSU;在联合片段分析中,种内和种间变异一致,LSU-tef1-rpb2-atp6>ITS-tef1-rpb2>ITS-LSU-rpb2。但在属级和种间水平鉴定准确性来看,只有LSU-tef1-rpb2-atp6才能准确鉴定所有属和属下物种。综合评价表明,在单片段中,rpb2更适宜作为斜盖伞属及其近缘属的DNA条形码;在联合基因片段中,LSU-tef1-rpb2-atp6最适合作为斜盖伞属及其近缘属的DNA条形码。2.DNA条形码技术在斜盖伞属及其近缘属分类中的应用用上述筛选出来的LSU-tef1-rpb2-atp6联合基因片段,构建斜盖伞属及其近缘属物种的系统发育树,并结合形态分类学方法分析该类群的物种多样性。结果表明:(1)斜盖伞属下可以划分为三组,即斜盖伞组(Section Clitopilus)、杯状斜盖伞组(Section Scyphoides)和皱纹斜盖伞组(Section Crispi),其中最后一个组为本研究成立的新组;(2)发现2个国内新记录属,即小斜盖伞属和拟斜盖伞属,7个新种;(3)国内共有17个种的分布,其中斜盖伞属10种,小斜盖伞属2种,拟斜盖伞属1种,4个待定种。
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