【摘 要】
:
目的:利用生物信息学探索CENPF在33种人类癌症中的生物学功能和相关机制,为肿瘤治疗提供新思路,寻找新的免疫治疗靶点。方法:利用人类蛋白质图谱(HPA)、基因型组织表达(GTEx)、基因型组织表达(TCGA)数据库从m RNA水平、蛋白水平分析CENPF在33种癌症的肿瘤组织及癌旁或正常组织的表达情况;采用免疫组织化学法检测南华大学附属第二医院18例结肠腺癌患者的结肠腺癌组织、癌旁组织中CENP
论文部分内容阅读
目的:利用生物信息学探索CENPF在33种人类癌症中的生物学功能和相关机制,为肿瘤治疗提供新思路,寻找新的免疫治疗靶点。方法:利用人类蛋白质图谱(HPA)、基因型组织表达(GTEx)、基因型组织表达(TCGA)数据库从m RNA水平、蛋白水平分析CENPF在33种癌症的肿瘤组织及癌旁或正常组织的表达情况;采用免疫组织化学法检测南华大学附属第二医院18例结肠腺癌患者的结肠腺癌组织、癌旁组织中CENPF蛋白的表达水平。R软件、Kaplan-Meier(KM)方法、对数秩检验、单基因COX方法分析不同类型肿瘤中CENPF表达水平与癌症患者总生存(OS)、疾病特异性生存(DSS)、无病生存(DFI)和无进展生存(PFI)等生存指标以及病理分期、年龄、性别等临床资料的相关性。斯皮尔曼(Spearman)秩检验分析泛癌中CENPF表达与肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星不稳定性(MSI)、肿瘤微环境(基质评分与免疫评分)以及22种免疫细胞浸润水平的相关性;皮尔森(Pearson)方法检验33种肿瘤中CENPF表达与47种常见免疫检查点基因表达的相关性。通过基因集富集分析网站(GSEA)对CENPF进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,探索CENPF在肿瘤中的潜在调控机制。结果:1、除胸腺及骨髓组织外,CENPF在其他人类正常组织中普遍低表达;CENPF在大部分人类肿瘤组织中显著高表达;CENPF蛋白在结肠腺癌组织中的表达明显高于癌旁组织(x~2=7.481,P=0.015)。2、在多种肿瘤中CENPF高表达与较短的总生存时间、疾病特异性生存期、无病生存期、无进展生存期相关;CENPF高表达与肿瘤不利的病理分期相关;CENPF表达与肿瘤患者的年龄有关,与肿瘤患者性别无关。3、CENPF表达水平与多种癌症的肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星不稳定性(MSI)有关。4、CENPF的表达水平与大部分肿瘤的基质评分、免疫评分呈负相关,与肿瘤微环境的免疫抑制有关;CENPF参与调节肿瘤免疫,与多种免疫细胞特别是肿瘤浸润性巨噬细胞明显相关,发挥免疫抑制作用,但在不同肿瘤类型中与不同的免疫细胞浸润中的关系不同。5、在部分肿瘤特别是甲状腺癌(THCA)中,CENPF的表达水平与多数免疫检查点基因表达显著正相关。6、基因富集分析显示,除了细胞周期途径,CENPF还调控包括机体免疫应答在内的多种途径参与肿瘤代谢及免疫过程。结论:1、CENPF在肿瘤中作为普遍的原癌基因促进肿瘤发生及发展过程,是预测肿瘤患者预后的生物标志物;2、CENPF可能是预测肿瘤患者对免疫疗法疗效的新型指标。3、CENPF参与肿瘤免疫过程,其潜在的免疫抑制作用有助于开发新的免疫治疗靶点。
其他文献
目的:探讨猪小肠黏膜下层(Porcine small intestinal submucosa,SIS)、脂肪干细胞基质胶(Stromal vascular fraction-gel,SVF-gel)对裸鼠皮肤急性创面修复的影响,为临床应用提供理论基础。方法:选取24只雌性balb/c+nu无胸腺裸鼠,在其背部建立直径约1cm大小类圆形的全层皮肤缺损创面模型,用随机数字表法,根据处理方法的不同分成
【目的】研究中国汉族人群RANK rs884205、rs6567270和rs4603673基因多态性与缺血性脑卒中的关系。【方法】采用病例-对照研究,选取2021.06-2021.12就诊于南华大学附属第二医院神经内科门诊或住院及体检中心共373例(缺血性脑卒中组/健康对照组=228/145),查阅文献及结合GWAS(Genome-Wide Association Studies)研究,筛选出RA
目的:目前,对于治疗脊髓型颈椎病(cervical spondylotic myelopathy,CSM)的最佳术式依旧存在相当大的争议。颈椎前路手术、后路手术均广泛用于治疗CSM。然而,综合性研究将前路手术与后路手术进行对比的研究较少。因此,我们进行了一项荟萃分析,以评估文献中的证据并比较两种手术的手术结果。基于CSM和后纵韧带骨化(Ossification of posterior longi
目的:观察术前予以连续髂筋膜间隙阻滞(Continuous fascia iliaca compartment block,CFICB)镇痛是否能降低老年髋部骨折患者术后谵妄的发生率,并通过检测相关炎症细胞因子来探索炎症反应与术后谵妄之间的关系。方法:选择本院ASA分级II-III级,年龄65-85岁的老年髋部骨折患者80例,随机分为神经阻滞组(A组)和常规镇痛组(B组)。神经阻滞组术前予以超声引
【目的】饮食与肾癌发病风险相关的证据尚不确定。本研究旨在总结饮食因素与肾癌发病风险相关的证据,并评估这些证据的强度和有效性。【方法】本研究对饮食与肾癌发病风险相关性的系统评价或meta分析(systematic reviews or meta-analyses,SRoMAs)进行伞形评价。根据PICOS原则确定纳入标准:研究类型:原始研究为观察性研究的SRoMAs(含剂量反应型或高低比较型meta
当下,新闻评论越来越重要。在媒介融合的大趋势下,一些昔日以新闻评论作为品牌的传统媒体,也步入了媒介转型和媒介融合的轨道。在此过程中,该怎样调整新闻评论以更好地适应新媒体环境,保持其媒体评论的品牌优势,是一个值得探讨的问题。文章以《新京报》作为研究个例,选取了《新京报》纸质版及其微信公众号"新京报评论"上同一时段内的新闻评论作为研究样本,总结其两个平台的新闻评论在选题框架和编辑方针上的特色。《新京报
“教—学—评”一体化强调教师的教学行为、学生的学习活动以及相应的诊断评估是三位一体的。为保证数学核心素养目标得以落实,需要从预期学习结果出发,以评价前置为创新点,注重学习过程体验的设计。基于小学生核心素养的培养,逆向教学设计在教学过程中实施多元评价,教师根据监测结果反馈目标的达成情况及时进行教学调整,为有效实施“教—学—评”一体化提供了支撑,助力落实素养导向下的新课程理念,为我们的教学明晰了方向。
目的:通过回顾我院非肌层浸润性膀胱癌(NMIBC)患者资料,研究术前血小板计数与C反应蛋白的乘积(P-CRP)对行经尿道膀胱肿瘤电切术(TURBT)患者术后无复发生存期(RFS)的影响,并结合病理资料,构建一个能够预测TURBT术后NMIBC患者RFS的Nomogram图。方法:本研究收录了从2013年1月至2019年12月在南华大学附属第二医院泌尿外科接受TURBT的NMIBC患者的临床资料,共
目的:探讨达格列净对2型糖尿病合并冠心病患者CD4+CD28-T细胞亚群的影响。方法:选取2021年2月-2022年2月在南华大学附属第二医院内分泌科及心血管内科就诊的患者,根据世界卫生组织(World Health Organization,WHO,1999)诊断标准确诊为2型糖尿病,冠状动脉造影提示心外膜下冠脉直径狭窄超过50%,且患者有典型心绞痛症状,诊断为冠心病,筛选单纯胰岛素治疗的2型糖
SOLO分类理论是一种量的测评与质的考查相结合的评价理论,该理论有助于深度开发结构化教学模式,达成核心素养导向的教学目标。运用SOLO分类理论指导教师以“评”促“教”,以“评”促“学”,实施结构化教学并及时跟踪评价,实现“教—学—评”一致,促进儿童思维发展进阶,最终促使课堂教学走向质的提升。