甘蓝型油菜主花序多角性状遗传分析及QTL定位

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近年我国油菜种植面积下降,农民种植油菜的积极性不高,主要是因为油菜生产机械化水平较低,因此培育适宜机械化收获的油菜品种是当前油菜育种最急迫的问题。适宜机械化收获的油菜品种应具有适宜密植的特性,油菜高密度种植时,主花序角果数对产量贡献较大,提高主花序角果数是选育适宜机械化收获油菜品种的方向之一。本研究12R1402是主花序多角变异材料经过多年选育,主花序多角性状稳定的新品系,该品系具有最高结角数250个,平均175个的特点,是适宜机械化收获的油菜品种选育及主花序多角果性状研究的优异种质。本研究用具有主花序多角油菜与常规油菜品系9302B配置正反交组合,构建6世代群体(P1、P2、F1、B1、B2和F2),对6世代群体主花序角果数采用混合遗传模型(主基因+多基因)进行分析,研究了主花序多角性状的遗传效应;采用高通量测序技术,对主花序多角油菜12R1402进行了全基因组重测序,对其SNP、Indel、SV等进行了分析;对组合沪油17×12R1402亲本间多态性SSR引物进行了筛选后构建遗传图谱并对主花序多角性状进行初定位。得到如下结果:1、主花序多角油菜×9302B组合的主花序多角性状遗传符合数量性状混合遗传模型E-1模型,受两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性多基因控制,其中,2对主基因加性效应值分别为-22.4148和-22.4148,都表现为负向效应,2对主基因显性效应值分别为67.0和56.9,都表现为正向增效。显性效应为两对主基因的主要效应,主花序多角性状表现为不完全显性。两对主基因中存在基因互作,在多基因中的加性效应值和显性效应值分别为64.2和-57.2。分离世代B1、B2和F2主基因遗传率分别为53.47%、97.39%和10.72%,多基因的遗传率分别为18.94%、0和0。正交组合主花序多角性状以主基因遗传为主,主花序多角性状适宜在育种早期世代筛选。9302B×主花序多角油菜反交组合的主花序多角性状遗传符合数量性状混合遗传模型E-1模型,受两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性多基因控制,第一对主基因的加性效应值和显性效应值分别为17.5和23.5,第二对主基因的加性效应值和显性效应值分别为17.5和-15.7,第一对主基因以显性效应为主,第二对主基因以加性效应为主,且两对主基因具有相同的加性效应,表现为正向增效。两对主基因存在基因互作,多基因加性和显性效应值分别为-44.6和-75.0,均表现为负向效应。B1、B2和F2分离世代主基因遗传率分别为97.9%、7.94%和74.07%,多基因遗传率分别为0、7.06%和0。反交组合主花序多角性状也是以主基因遗传为主,同样适宜早期选择。2、运用重测序技术对主花序多角油菜和沪油17的全基因组进行重测序,测序的深度为20×,获得49.89Gbp数据量,Q30达到89%以上,两样本与参考基因进行比对其效率达到93%。其中主花序多角油菜,共检测到714490个单核苷酸类型的多态位点,363021个小片段缺失类型的位点,44099个结构类型变异;各类型的变异使得4 809个基因发生变异。3、对主花序多角油菜和沪油17两亲本间多态性引物进行筛选,从2000对引物中筛选出209引物具有多态性,并用F1和10株F2的单株进行复筛最终选出90对多态性稳定的引物,多态性比例为4.5%。4、以沪油17为母本12R1402为父本的组合构建F2群体共280个单株进行遗传图谱的的构建,对主花序多角性状进行了QTL初步定位结果表明在标记Bn GMS291和标记Bn GMS416间有一个QTL位点,两标记均位于A3染色体上,LOD值是5.3619,加性效应值是-16.1336,表型贡献率是9.297%。
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