环境保护部门和水利部门分别从水环境保护角度和流域统一管理的角度,将水体划分为不同的功能区。环保部门把水体划分为“水环境功能区”,而水利部门把水体划分为“水功能区”。在各流域中,两个不同功能区既相似又有不同,水环境功能区主要针对水质来划分,水功能区主要针对水量来划分,两功能区同时存在同一水体上使管理决策者不知道使用哪种功能区划更准确,容易造成管理上的混乱,难以实现水质目标的统一管理,难以实现水质目标的统一管理。两功能区不能同时存在于同一水体上,两种不同水质目标区划并存的格局必须改变。本文以海河流域为例,在海河流域上收集水利部门的水功能区和环保部门的水环境功能区数据,采用海河流域地表水文数据库(HAINHD)河段编码模型,把两功能区在GIS中叠加到一起,重叠部分采用高标准要求,就高不就低的原则确定水质目标,不重叠的部分采用原有区划的水质目标。最后再把重叠部分和不重叠部分叠加到一起,形成环保部门和水利部门均认可的流域功能区划。整编后的流域功能区划应改变传统的污染源管理和水质管理相脱节的问题,将陆上污染源监督管理向水体质量管理延伸,按照流域—区域—污染源、水体和陆上、二个层次三个级别为工作主线,水陆并重,对水污染防治工作实行全面管理。以功能区划要求定监测断面,定监测数据的评价标准,引导新的评价体系,定陆上污染源执法标准,定区域总量控制指标,定污染源的排污许可,将功能区划作为环境监测、环境评价、总量控制、排污收费、污染源管理等工作的基石,作为今后水环境管理按要素归口一条龙管理的出发点。