LCT、LCE、TSHR基因多态性在中国北方人群中的分布及相关研究

来源 :哈尔滨医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhoudeyou
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目的:乳糖不耐受、银屑病和Graves病是北方人群的常见疾病,因发病原因尚不清楚,是当前科学研究的热点。乳糖酶(lactase)是乳糖代谢的关键酶,乳糖酶基因(LCT)基因上的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点与不同民族的乳糖不耐受机制相关。与欧洲人群的乳糖不耐受显著相关的LCT-13910T等位基因在非洲和亚洲人群中的频率很低,无法解释其中一些民族的乳糖不耐受机制。2006年,Tishkoff等人在对3个非洲人群进行的基因型表型相关研究中发现了3个新的SNP位点:LCT-13907C/G、-13915T/G和-14010G/C,其中-13907C、-13915T、-14010G与乳糖不耐受相关。这些多态位点均处于-13910T与Oct-1的结合区域周围,但作用机制尚不清楚。银屑病是一种常见的皮肤慢性疾病,通常发生在15-30岁之间,没有性别差异。因其容易复发的特点,严重影响患者的身心健康,约40%的患者伴有关节损伤、肿瘤及其他自身免疫系统疾病,目前尚无特效的治疗方法。晚期编码角质化包膜(late comified envelope,LCE)基因是银屑病的易感基因,在其发生中发挥重要作用。LCE3B和LCE3C基因的缺失与欧洲人群的银屑病密切相关,然而在中国人群中未见报道。Graves病(弥漫性甲状腺肿伴甲亢)是一种常见的以甲状腺功能亢进为主征的器官特异性自身免疫性疾病,其人群发病率为0.5-1.0%,女性多发。促甲状腺激素受体(TSHR)基因是Graves病的易感基因之一,其内含子1中的3个新发现的SNP位点(rs179247,rs12101255和rs2268458)与欧洲人群的Graves病明显相关,但在中国人群中未见相关报道。本研究主要针对LCT, LCE、TSHR基因中的SNP位点在中国北方人群中的分布及LCE基因与银屑病、TSHR基因与Graves的关联性进行了初步探讨。   方法:本研究利用PCR-RFLP、测序等方法分析了LCT基因3个新发现的多态位点-13907C/G、-13915T/G和-14010G/C,和1个常见位点-22018G/A在中国北方6个人群的546个个体中的遗传多样性,初步探讨其与乳糖不耐受的相关 性。利用PCR的方法,检测了北方257例银屑病患者和269例正常对照中LCE3C_LCE3B基因缺失情况及其与银屑病的相关性。利用PCR-RFLP的方法检测了北方199例Graves病患者和208例正常对照中TSHR rs179247,rs12101255和rs2268458位点的分布及其与Graves病的相关性。   结果:在LCT基因多态性的研究中,我们发现LCT-22018A等位基因频率在哈萨克族中最高,在北方汉族中最低,并且该位点分布特征与北方人群的乳糖不耐受频率基本一致。而LCT-13907C/G、-13915T/G和-14010G/C在北方人群中为单态位点。在银屑病的关联研究中,LCE3C_LCE3B基因缺失频率在病例-对照间存在显著差异(P<0.001)。亚组分析时,缺失频率在男性患者和男性对照之间存在显著差异(P=0.001),在有家族史的银屑病患者和正常对照间存在显著差异(P=0.001),在早发型银屑病患者和正常对照间存在显著差异(P=0.003)。在Graves病的关联研究中,TSHR rs179247,rs12101255和rS2268458这3个SNP位点与Graves病发生均无显著相关性(P>0.05),而且它们所构成的8种单体型与Graves病均无显著相关性(P>0.05)。   结论:LCT基因在中国北方人群中的多态性研究,提示-22018A等位基因频率在北方6个人群间存在明显差异,该位点分布特征与北方人群的乳糖不耐受表型频率基本一致,可能对其表型起着关键作用。LCE基因缺失与银屑病的关联研究,提示LCE3C_LCE3B基因缺失是北方汉族人群银屑病的重要易感基因,与性别、家族史和发病年龄相关。TSHR基因多态性与Graves病的关联研究提示,TSHRrS179247,rs12101255和rs2268458及其构成的单体型与北方人群Graves病无显著相关性。
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