近年来,复杂性科学的研究在国内外迅速兴起,其中对复杂系统理论的研究已经遍布当前科学所能涵盖的大多数领域。其研究和发展为人类提供了更多的探索世界的新思维、新工具、新方法,从而使得一些传统的思想、理论、方法的不足和缺陷逐渐暴露出来。层次分析法作为一种多目标决策方法,自提出以来已经在管理科学、多目标决策等众多领域得到了广泛的应用。根据层次分析法原理,从复杂系统理论出发,本文认为在应用层次分析法处理复杂系统问题时存在着一定的缺陷。为了克服文中所提出的缺陷,本文在层次分析法原理的基础上,应用复杂系统理论、人工神经网络理论方法、交合分析法、摆幅置权理论,探索出了面向复杂系统决策的层次分析权重处理方法。通过数值模拟实验研究和案例应用研究,证明了该方法具有科学性、有效性、实用性和可操作性。