新三板又称全国中小企业股份转让系统，2013年12月31日，全国中小企业股份转让系统正式面向全国接收企业挂牌申请。新三板定位于服务广大的中小企业，为成长型、创新型中小企业提供股份转让和融资服务，对我国经济发展、产业结构调整、资本市场的完善均具有重要意义。目前，新三板市场对挂牌公司实施分层管理，分为创新层和基础层，同时交易方式分为做市转让和协议转让。同一个市场分为这两种不同的交易方式，足以见得新三板市场的特殊性。　　流动性作为市场运行效率的重要指标之一，股转系统也一直通过完善相关制度来解决新三板企业的流动性问题，足以说明流动性对于新三板市场的重要性。而收益率又是投资者进行投资最为看重的一个指标，本文通过对新三板市场流动性水平的研究，分析不同交易方式下流动性的区别以及影响流动性的因素，最后基于流动性溢价的相关理论，实证研究流动性对于新三板市场股票收益率的影响，得到流动性溢价理论在我国特殊的新三板制度下是否适用，以及不同的交易方式适用情况是否一致。　　本文首先介绍了新三板市场的现状，在研究政策与新三板市场交易规则的基础上分析目前新三板市场缺乏流动性的问题所在。然后根据相关文献和新三板市场的运行特点，选择换手率与非流动性比率作为自变量，收益率作为因变量，分别对分层制度前后，做市商制度和协议转让制度的不同实证研究流动性对收益率的影响。得出结论，不同的交易方式，以及收益率表现为正和负的不同，流动性对收益率的影响也不同。