军团菌是引起军团病的病原菌，军团病的主要危害在于致死率高并且发病初期不易察觉。引起军团病的致病军团菌有数十种，其中最常见病原体为嗜肺军团菌，其次是米氏军团菌，再次是博滋曼军团菌和杜莫夫军团菌，还有其它类型致病军团菌的报道。军团病感染多是由冷热水管道包括空调，工业用水系统等产生的包含有军团菌的溶胶颗粒与人类接触引起。　　 目前随着空调，供水系统，加湿器等设备在社会生活中的广泛使用，军团病病例的发生在当代越发的频繁。因此，采取快速有效的致病军团菌鉴定手段成为当务之急。目前常见的鉴定手段主要有标本培养观察，抗体检测，生化手段检测等，但都存在着准确性差，周期长等缺点。本研究的目的就是通过利用军团菌16S-23S间区(ITS)序列的特异性并结合基因芯片的手段建立一种快速、高效、准确的鉴定方法。　　 本研究针对10种常见致病军团菌包括嗜肺军团菌，安氏军团菌，博滋曼军团菌，杜莫夫军团菌，费菲军团菌，戈尔曼军团菌，乔丹河军团菌，长滩军团菌，米氏军团菌，迈氏军团菌的ITS序列，设计了29条特异性探针，并以ITS序列设计正对照探针，共计30条探针。之后点制芯片，PCR条件优化，杂交液的选择，杂交温度的优化，最后进行芯片特异性实验，盲测，灵敏度评价，模拟样品实验和实际样品实验，最终确立了一种针对10种常见致病军团菌的快速，有效的检测手段，为以后该芯片在实际生活中的广泛使用奠定了基础。