【摘 要】
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目的通过分析2012-2015上海地区成年人甲型H3N2流感病毒的分子流行病学及HA抗原漂变情况,从而了解甲型H3N2流感病毒分子流行及变异变迁规律。方法采集2012-2015年间上海地区三家哨点医院流感样成人病例的呼吸道标本,收集临床资料。提取标本核酸后用实时荧光PCR检测流感病毒,对甲型流感病毒阳性的标本进一步进行基因分型。对H3N2阳性标本扩增血凝素(HA)基因片段、测序和进行基因变异分析。
【机 构】
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201508 上海,复旦大学附属公共卫生临床中心,201508 上海市公共卫生临床中心,201508 上海市公共卫生临床中心,201508 上海市公共卫生临床中心,201508 上海市公共卫生临床中心
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目的通过分析2012-2015上海地区成年人甲型H3N2流感病毒的分子流行病学及HA抗原漂变情况,从而了解甲型H3N2流感病毒分子流行及变异变迁规律。
方法采集2012-2015年间上海地区三家哨点医院流感样成人病例的呼吸道标本,收集临床资料。提取标本核酸后用实时荧光PCR检测流感病毒,对甲型流感病毒阳性的标本进一步进行基因分型。对H3N2阳性标本扩增血凝素(HA)基因片段、测序和进行基因变异分析。
结果总共收集2 346例病例,甲型流感病毒核酸检测阳性病例331例,其中273例为H3N2流感病毒阳性,58例为2009 pdmH1N1流感病毒阳性。2012年-2015年期间,上海地区H3N2流感病毒在每年的冬春季流行,但在2014年和2015年均呈现夏季流行高峰。对2012年-2015年间获得的上海地区180个H3N2流感病毒的HA基因全长序列进行系统进化树分析发现:2012-2015年间H3N2流感病毒总共引起了3个主要的流感流行峰,分别是2013年12月-2014年1月、2014年7-8月和2015年7-8月,且分别属于三个不同的基因簇:A/Finland/385/2013类似株,为group 3C.3b;A/Switzerland/9715293/2013类似株(SW13),为group 3C.3a和A/Hong Kong/5783/2014类似株(HK14),group 3C.2a分支。比较3个流行峰的甲型H3N2流感病毒,发现血凝素蛋白氨基酸序列存在一定差异,主要分布于抗原表位和受体结合位点(RBS)。
结论2012-2015年间,上海地区流行的H3N2流感病毒出现明显的2次抗原漂变,可能是导致上海地区近年来H3N2流感流行的原因。
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